CD audio disimpan dalam media dalam bentuk yang tidak dikompresi asalnya pada kadar bit 1411bits / saat. CD MP3 disimpan dikompresi pada bit bit berbeza-beza sekitar 64 hingga 256 bit sesaat. Kelebihan utama CD MP3 adalah perbezaan besar dalam jumlah fail yang disimpan dalam cakera tunggal. Ini boleh beratus-ratus berbanding dengan 15 hingga 20 lagu yang boleh disimpan ke dalam CD audio.
CD audio telah menjadi standard dalam format muzik mudah alih untuk masa yang sangat lama. Ia adalah format pertama muzik yang dikodkan, dan oleh itu semua pemain muzik yang menerima CD dapat memainkan format yang sangat asas ini. Satu kelebihan bahawa CD audio mempunyai CD MP3 adalah bunyi berkualiti tinggi yang dapat disampaikan oleh CD audio. Format yang tidak dimampatkan bermaksud tiada data yang hilang disebabkan oleh mampatan. Perkakasan yang diperlukan untuk memainkan CD Audio adalah lebih mudah berbanding dengan pemain MP3.
CD MP3 pecah ke tempat kejadian sebentar selepas format diperkenalkan. MP3 adalah kaedah lossy untuk memampatkan fail audio. Ini bermakna bahawa sesetengah data perlu dibuang untuk mengurangkan saiz fail dengan ketara. Satu-satunya aspek yang baik dari MP3 adalah hakikat bahawa ia boleh menjadi kesepuluh saiz fail yang sama dalam format CD Audio. Kehilangan maklumat bunyi bermaksud bahawa MP3 tidak kalah dengan CD Audio apabila dimainkan semula dalam peralatan bunyi tinggi; walaupun pembangunan codec yang lebih baik secara beransur-ansur mengurangkan jurang antara keduanya.
Perbezaan besar antara CD Audio dan CD MP3 boleh datang dari perkakasan untuk kedua-dua format. Seperti yang dinyatakan di atas, semua pemain dapat memainkan CD Audio tetapi ini mungkin tidak betul-betul berlaku dengan CD MP3. Walaupun jumlah peranti yang dapat memainkan CD MP3 telah berkembang dalam beberapa tahun kebelakangan ini, ia masih tidak ada lagi seperti yang ditetapkan sebagai format CD Audio. Dan trend semasa kepada pemain MP3 yang bertindak sebagai media penyimpanan sendiri telah mengurangkan lagi sokongan untuk pemain CD mudah alih yang menyokong format MP3.
Pada masa ini, MP3 adalah format yang paling lazim apabila ia datang kepada pemain mudah alih walaupun menjejaskan CD MP3 secara tiba-tiba. Format CD Audio masih memegang kehadiran pasaran yang besar kerana ia masih menjadi medium pilihan dalam penjualan album muzik.