Differkinome

Perbezaan Antara AFLP dan RFLP

Sains & Alam
Share

Perbezaan Utama - AFLP vs RFLP
  

Kajian DNA mempunyai kepentingan yang besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik dan genom organisma pemetaan. Beberapa teknik yang dikaitkan dengan analisis DNA juga digunakan untuk mengenal pasti gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenali sebagai penanda molekul. Polymorphism Length Fragment Amplified (AFLP) dan Sekatan Panjang Fragmen Polimorfisme (RFLP) adalah dua penanda molekul (kaedah) yang dihasilkan dalam biologi molekular untuk mengesan variasi genetik antara organisma. Kedua-dua kaedah adalah sama penting dan mempunyai kelebihan dan kekurangan. Perbezaan utama antara AFLP dan RFLP ialah AFLP melibatkan amplifikasi PCR terpilih DNA yang dicerna sementara RFLP tidak melibatkan penguatan PCR terpilih serpihan DNA.

KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu AFLP
3. Apakah RFLP
4. Side by Side Comparison - AFLP vs RFLP
5. Ringkasan

Apakah AFLP itu??

AFLP (Panjang Fragment Polimorfisme Amplified) adalah alat penting dalam biologi molekul dan digunakan secara meluas dalam analisis variasi genetik. AFLP didasarkan pada amplifikasi PCR spesifik DNA genomik yang berpecah dan pengesanan polimorfisme dengan autoradiographs melalui elektroforesis gel. AFLP banyak menyumbang untuk mengenal pasti perbezaan genetik dalam strain atau spesies yang berkaitan dengan pelbagai kerajaan termasuk tumbuhan, haiwan, bakteria dan kulat. AFLP boleh dilakukan dengan sedikit sampel DNA yang tidak diketahui. Ia tidak memerlukan pengetahuan urutan terdahulu dan reka bentuk probe.

Langkah-langkah AFLP

  1. Pengasingan DNA
  2. Pencernaan DNA dengan endonucleases sekatan
  3. Ligation fragmen DNA yang disekat dengan penyesuai
  4. Penguatan selektif serpihan dengan tapak sekatan tertentu
  5. Pemisahan produk PCR oleh elektroforesis gel
  6. Visualisasi matriks gel dengan autoradiograph

AFLP adalah kaedah yang lebih sensitif dan boleh dihasilkan yang boleh digunakan dalam profil DNA beberapa taksiran termasuk kulat, bakteria, tumbuhan dan haiwan tanpa pengetahuan urutan DNA terlebih dahulu. Ini membantu mengenal pasti perbezaan sedikit di kalangan individu dalam populasi kerana sifatnya yang sangat sensitif. AFLP juga penting dalam pemetaan genom, kajian forensik, ujian ibu bapa, genotyping, dan lain-lain.

Rajah 01: AFLP

Apakah RFLP itu?

Sekatan Fragment Length Polymorphisms (RFLPs) adalah teknik yang digunakan untuk mengesan variasi genetik dalam urutan DNA homologous. Ini adalah kaedah pertama yang dibangunkan untuk profil DNA. Organisma mempunyai cap jari DNA unik atau profil DNA. RFLP berfungsi sebagai alat penting untuk menganalisis variasi antara profil DNA intraspecific atau organisma yang berkait rapat sejak urutan homolog mempunyai lokasi sekatan yang berbeza (lokasi) yang unik untuk organisma tertentu. Apabila DNA homolog dicerna dengan endonucleases sekatan tertentu, ia akan menghasilkan profil DNA yang unik yang unik kepada setiap individu. Oleh itu, pengetua kaedah ini adalah pengesanan variasi genetik di kalangan organisma dengan menyekat DNA homolog dengan enzim sekatan tertentu dan analisis polimorfisme panjang serpihan melalui elektroforesis gel dan membungkus. Corak pemotongan adalah unik kepada setiap organisma dan mencirikan genotip tertentu.

Langkah-langkah RFLP

  1. Pengasingan jumlah DNA yang mencukupi dari sampel
  2. Pemecahan sampel DNA dengan endonucleases sekatan tertentu ke dalam urutan pendek
  3. Pemisahan serpihan yang dihasilkan dengan panjang yang berbeza dengan elektroforesis gel agarosa.
  4. Pemindahan profil gel ke dalam membran oleh pembengkakan Selatan

  5. Hibridisasi membran dengan probe berlabel dan analisis polimorfisme panjang serpihan dalam setiap profil

RFLP adalah teknik yang sangat penting dalam mengesan pewarisan penyakit dan mencari risiko terjadinya penyakit di kalangan ahli keluarga. RFLP juga sering digunakan dalam pemetaan genom, mengenal pasti penjenayah dalam forensik, ujian paterniti, dan sebagainya. RFLP mempunyai beberapa batasan juga. RFLP memerlukan pengetahuan terlebih dahulu mengenai data urutan untuk merancang probe untuk hibridisasi. Ia juga memerlukan pengasingan jumlah DNA yang mencukupi dari sampel untuk dianalisis, yang sukar dilakukan dalam kajian forensik.

Rajah 01: Pemetaan RRFLP

Apakah perbezaan antara AFLP dan RFLP?

ALFP vs RFLP
AFLP melibatkan amplifikasi PCR terpilih DNA yang dicerna. RFLP tidak melibatkan PCR kecuali PCR-RFLP.
Pengetahuan Sequence
Pengetahuan urutan terdahulu tidak diperlukan. Pengetahuan urutan terdahulu diperlukan untuk membuat probe RFLP.
Kebolehpercayaan
Ini lebih dipercayai. Ini tidak boleh dipercayai berbanding dengan AFLP.
Kecekapan dalam Mengesan Polimorfisme
Ini mempunyai kecekapan yang lebih tinggi dalam mengesan polimorfisme daripada RFLP. Ini kurang cekap berbanding dengan AFLP.
Kos
Ini agak mahal berbanding dengan RFLP. Ini lebih murah berbanding AFLP.
Permohonan
AFLP telah digunakan untuk pemetaan genom, cap jari DNA, kajian kepelbagaian genetik, ujian bapa dan forensik Analisis RFLP adalah alat penting dalam pemetaan genom, lokalisasi gen untuk gangguan genetik, penentuan risiko penyakit, dan ujian bapa.

Ringkasan - AFLP vs RFLP

AFLP dan RFLP adalah dua teknik yang digunakan sebagai penanda genetik untuk penilaian kepelbagaian dan penilaian hubungan genetik dalam biologi molekular. AFLP berfungsi sebagai kaedah yang cekap dan sensitif untuk mengesan polimorfisme genetik antara organisma daripada RFLP. Walau bagaimanapun, walaupun kedua-dua kaedah ini mempunyai kecekapan yang berbeza dalam mengesan variasi genetik, mereka masih digunakan untuk diagnosis cap jari DNA dan diagnosis penyakit.

Rujukan:
'1. Garcia, Antonio A. F., Luciana L. Benchimol, Antônia M. M. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio L., dan Anete P. De Souza. "Perbandingan penanda RAPD, RFLP, AFLP dan SSR untuk kajian kepelbagaian dalam garis jagung jagung tropika." Genetik dan Biologi Molekul. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. 19 Mac 2017
2. "Sekatan Panjang Fragment Polymorphism (RFLP)." Pusat Kebangsaan Maklumat Bioteknologi. Perpustakaan Perubatan Negara A.S., n.d. Web. 19 Mac 2017
3. Masiga D. K. dan Turner C. M. (2004). "Amplifikasi (sekatan) analisis polimorfisme panjang serpihan (AFLP)". Kaedah Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. 19 Mac 2017

Image Courtesy:
1. "ALFP" Oleh Barbarossa di Wikipedia bahasa Belanda - Dipindah dari nl.wikipedia ke Commons. (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2. "Pemetaan RFLP" oleh Retama - Kerja sendiri (GFDL) melalui Wikimedia Commons

Sains & Alam
×