Perbezaan Antara Benzonase dan DNase

Perbezaan Utama - Benzonase vs DNase

Degradasi asid nukleik adalah penting untuk banyak teknik biologi molekul. Ia digunakan secara meluas dalam teknologi DNA rekombinan untuk menghilangkan serpihan DNA dan RNA yang tidak diingini. Asid nukleik yang merendahkan enzim dirujuk sebagai Nukleus, dan mereka boleh berbeza mengikut fungsi yang diperlukan. Nukleases yang merendahkan DNA dikenali sebagai DNases manakala yang merendahkan RNA dikenali RNases. Enzim-enzim ini kebanyakannya digunakan dalam dalam vitro eksperimen di mana dalam vitro Ujian molekul dilakukan untuk mengasingkan DNA tulen, RNA atau protein. Benzonases adalah sejenis nukleus yang merendahkan kedua-dua DNA dan RNA manakala DNases merosakkan DNA sahaja. Ini adalah perbezaan utama antara Benzonase dan DNase.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Benzonase
3. Apakah DNase
4. Kesamaan Antara Benzonase dan DNase
5. Side by Side Comparison - Benzonase vs DNase dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apakah Benzonase??

Benzonase adalah endonuclease kejuruteraan genetik dari Serratia marcescens. Enzim ini dihasilkan di E coli tuan rumah dalam skala perindustrian. Benzonase mampu mengekang DNA double-stranded, DNA linier, DNA pekeliling dan RNA tunggal terkandas. Oleh itu, Benzonase secara komersil penting. Enzim Benzonase adalah dimer protein yang mempunyai 245 asid amino yang sama, ~ 30 kDa subunit dengan dua ikatan disulfida penting. Benzonase memecahkan asid nukleat pada akhir 5 'dan menghasilkan serpihan dengan 5'''ren percuma. Benzonase boleh memecahkan asid nukleat pada sebarang urutan tetapi lebih suka kawasan kaya GC.

Benzonase disimpan di -20 ⁰C. PH optimum untuk aktiviti enzim didapati 8.0 - 9.2. Aplikasi Benzonase termasuk penyediaan sampel untuk elektroforesis gel 2D protein di mana Benzonase menghilangkan asid nukleat dan penyingkiran asid nukleik dari persiapan protein rekombinan. Ia juga digunakan untuk mengurangkan kelikatan ekstrak protein dan mencegah pengumpanan sel dalam campuran sel.

Apa itu DNase?

DNase adalah sejenis enzim hidrolisis, yang hanya dapat mengekang DNA dua stranded. Terdapat dua jenis utama DNases: DNase I dan DNase II. DNase I mengambil bahagian dalam mengekalkan DNA double-stranded untuk menghasilkan polynucleotides dengan 5 'hujung percuma. DNase II terlibat dalam mengekalkan DNA double stranded untuk menghasilkan helai polynucleotide dengan 3 'hujung percuma atau overhangs.

DNase I

Fungsi DNase I pada pH optimum antara 7.0 - 8.0. Aktiviti enzim bergantung kepada banyak koefaktor ionik yang termasuk, Ca²⁺, Mg²⁺ atau Mn²⁺. Aktiviti Mg²⁺ dan Mn²⁺ memutuskan fungsi DNase I. Dengan kehadiran Mg²⁺, DNase I memegang setiap helai dsDNA secara bebas. Ini berlaku secara rawak. Sebaliknya, dengan kehadiran Mn^2+, enzim itu memecahkan kedua-dua helai DNA di sekitar tapak yang sama. Pembelahan ini akan menghasilkan dua jenis serpihan DNA; satu jenis dengan hujung tumpul dan satu lagi jenis dengan satu atau dua overhang nukleotida.

Rajah 02: DNase

DNase II

Fungsi DNase II pada pH optimum 4.5-5.0 dan ion logam divalen diperlukan untuk aktivitinya, sama seperti DNase I. Mekanisme DNase II diketahui terdiri daripada tiga langkah utama.

Rembatan serat tunggal berganda diinduksi dalam tulang belakang DNA.
Nukleotida larut asam dan oligonukleotida dihasilkan.
Peralihan hyperchromic tidak linear berlaku pada fasa terakhir.

Perencat utama enzim DNase termasuk logam chelators, logam peralihan dan bahan kimia seperti natrium dodecyl sulfate dan β - mercaptoethanol.

Aplikasi utama DNase termasuk penyediaan ekstrak RNA DNA dan ekstrak protein tanpa DNA, dan penyingkiran DNA template semasa eksperimen transkripsi in vitro.

Apakah Kesamaan Antara Benzonase dan DNase?

Kedua-duanya adalah enzim hidrolisis.
Kedua-duanya adalah nukleus.
Kedua-duanya menyertai dengan mengekalkan ikatan fosfodiester asid nukleik.
Kedua-duanya memerlukan pH optimum dan suhu penyimpanan untuk mengekalkan aktiviti enzim.
Inhibitor enzim termasuk agen chelating, logam peralihan, dan bahan kimia pencuci.
Aplikasi terutamanya memberi tumpuan kepada mendapatkan ekstrak ketulenan tinggi DNA, RNA, dan protein.
Kedua-dua enzim boleh dihasilkan melalui kejuruteraan genetik.

Apakah Perbezaan Antara Benzonase dan DNase?

Benzonase vs DNase
Benzonase adalah enzim yang mampu mengekang DNA double-stranded, DNA linear, DNA bulat, dan RNA.	DNase adalah enzim yang mampu mengekang DNA double-stranded.
Substrat untuk Enzim
Kedua-dua DNA dan RNA adalah substrat untuk benzonase.	DNA adalah substrat untuk DNase.
Struktur
Julatase pH optimum Benzonase adalah 7.0 -8.0	Rangkaian pH optimum DNase I adalah 7.0 - 8.0 dan DNase II adalah 4.5 - 5.0.

Ringkasan - Benzonase vs DNase

Enzim nuklease digunakan secara meluas dalam pelbagai prosedur percubaan berkaitan dengan biologi molekul dan kejuruteraan genetik. Benzonase dan DNase adalah dua jenis nukleus. Benzonase terlibat dalam merosakkan kedua-dua DNA dan RNA manakala DNase terlibat dalam mengekang DNA dua stranded. Ini adalah perbezaan asas antara benzonase dan DNase. Pada masa ini, kedua jenis nikmat ini dihasilkan melalui teknologi DNA rekombinan yang menghasilkan enzim berkualiti tinggi yang dioptimumkan untuk pengeluaran maksimum.

Muat turun Versi PDF dari Benzonase vs DNase

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti nota kutipan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara Benzonase dan DNase

Rujukan:

1. "Deoxyribonuclease saya dari pancreas sapi D5025." Sigma-Aldrich, terdapat di sini. Diakses pada 19 Sept. 2017.
2. "Deoxyribonuclease II." Deoxyribonuclease II - Worthington Enzyme Manual, Available here. Diakses pada 19 Sept. 2017.

Image Courtesy:

1. "Laman DNA hipersensitif" oleh Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. - Wang Y-M, Zhou P, Wang L-Y, Li Z-H, Zhang Y-N, et al. (2012) Korelasi Antara DNase I Pengedaran Tapak Hypersensitive dan Ekspresi Gene di Sel S HeLa S3. PLOS ONE 7 (8): e42414. doi: 10.1371 / journal.pone.0042414 (CC BY-SA 2.5) melalui Wikimedia Commons

Sains & Alam