Perbezaan Antara Kaki dan Melompat Kromosom

Perbezaan Utama - Chromosome Walking vs Jumping

Kromosom berjalan dan kromosom melompat adalah dua alat teknikal yang digunakan dalam biologi molekular untuk mencari gen pada kromosom dan pemetaan fizikal genom. Walking kromosom adalah teknik yang digunakan untuk mengklonkan gen sasaran dalam pustaka genomik dengan pengasingan berulang dan kloning klon-klub yang bersebelahan pustaka genomik. Melompat kromosom adalah versi khas berjalan kromosom yang mengatasi titik putus kromosom berjalan. Walking kromosom boleh hanya urutan dan peta panjang kromosom kecil manakala melompat kromosom membolehkan penjujukan sebahagian besar kromosom. Ini adalah perbezaan utama antara berjalan kaki kromosom dan kromosom lompat.

KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Kromosom Berjalan
3. Apa yang Melompat Kromosom
4. Side by Side Perbandingan - Chromosome Walking vs Jumping
5. Ringkasan

Apa yang Kromosom Berjalan?

Walking kromosom adalah alat yang mengeksplorasi kawasan turutan kromosom yang tidak diketahui dengan menggunakan serpihan sekatan bertindih. Dalam kromosom berjalan, sebahagian daripada gen diketahui digunakan sebagai penyelidikan dan terus dengan mencirikan panjang penuh kromosom untuk dipetakan atau dijujukan. Ini berlaku dari penanda kepada panjang sasaran. Dalam kromosom berjalan, hujung setiap serpihan bertindih digunakan untuk hibridisasi untuk mengenal pasti urutan seterusnya.

Probe yang disediakan dari kepingan akhir DNA kloning dan subcloned. Kemudian mereka digunakan untuk mencari fragmen bertindih seterusnya. Semua urutan yang bertindih ini digunakan untuk membina peta genetik kromosom dan mencari gen sasaran. Ini adalah satu kaedah menganalisis panjang DNA yang panjang dengan serpihan yang bertindih kecil dari perpustakaan genomik yang baru.

Teknik Berjalan Chromosome - Langkah-langkah

Pengasingan fragmen DNA yang mengandungi gen atau penanda yang diketahui berhampiran gen sasaran
Penyediaan peta sekatan serpihan yang dipilih dan subcloning rantau akhir serpihan untuk digunakan sebagai penyelidikan
Hibridisasi penyelidikan dengan serpihan bertindih seterusnya
Penyediaan peta sekatan serpihan 1 dan subcloning rantau akhir pecahan 1 untuk digunakan sebagai penyelidikan untuk pengenalpastian serpihan yang bertindih seterusnya.
Hibridisasi penyelidikan dengan serpihan bertindih seterusnya 2
Penyediaan peta sekatan serpihan 2 dan subcloning rantau akhir serpihan 2 untuk berfungsi sebagai penyelidikan untuk mengenal pasti serpihan bertindih seterusnya

Langkah-langkah di atas harus diteruskan hingga gen sasaran atau hingga akhir 3 'dari jumlah panjang urutan.

Rajah 01: Teknik Berjalan Kromosom

Walking kromosom adalah aspek penting dari cytogenetic dalam mencari SNPs dari banyak organisma dan menganalisis penyakit genetik yang ditemui dan mencari mutasi gen yang relevan.

Apa yang Melompat Kromosom?

Melompat kromosom adalah teknik yang digunakan dalam biologi molekular untuk pemetaan fizikal genom organisma. Teknik ini diperkenalkan untuk mengatasi halangan berjalan kaki kromosom yang timbul apabila mencari kawasan DNA berulang semasa proses pengklonan. Oleh itu, teknik melompat kromosom boleh dianggap sebagai versi khas berjalan kromosom. Ini adalah kaedah yang cepat berbanding dengan berjalan kromosom dan membolehkan melangkau urutan DNA berulang yang tidak terdedah untuk diklon semasa berjalan kromosom. Melompat kromosom menyempitkan jurang antara gen sasaran dan penanda yang diketahui untuk pemetaan genom.

Alat melompat kromosom bermula dengan pemotongan DNA khusus dengan endonukleases sekatan khas dan ligasi serpihan ke dalam gelung beredar. Kemudian buku asas yang direka dari urutan yang diketahui digunakan untuk mengurutkan gelung beredar. Primer ini membolehkan melompat dan menyusun secara alternatif. Oleh itu, ia boleh memintas urutan DNA berulang dan dengan pantas berjalan melalui kromosom untuk mencari gen sasaran.

Penemuan encoding gen untuk penyakit fibrosis kistik telah dilakukan menggunakan alat melompat kromosom. Digabungkan bersama, melompat dan berjalan kromosom boleh meningkatkan proses pemetaan genom.

Rajah 02: Melompat Kromosom

Apakah perbezaan antara Walking and Jumping Chromosome?

Chromosome Walking vs Jumping
Kromosom adalah alat yang digunakan dalam biologi molekular untuk pemetaan genom dan mencari gen tertentu.	Jumpa kromosom adalah alat yang digunakan untuk pemetaan fizikal genom dan penemuan pantas gen sasaran dalam kromosom.
Panjang Perbandingan Urutan
Hanya serpihan kecil sahaja yang dapat diklonkan oleh berjalan kromosom.	Panjang lebih besar kromosom boleh dipetakan oleh melompat kromosom.
Pengklonan DNA Berulang dalam Kromosom
Teknik berjalan kaki kromosom mempunyai kesukaran untuk berjalan melalui urutan DNA berulang yang terdapat di kromosom.	Ia membolehkan melangkau urutan DNA berulang. Oleh itu, tidak ada kesukaran apabila mendapati mereka semasa penjujukan.
Faktor yang Mempengaruhi Proses
Kejayaan proses bergantung kepada saiz genom dan jarak yang mesti "berjalan" dari kedudukan genom yang diketahui ke arah gen yang dikehendaki.	Kejayaan tidak bergantung pada saiz genom jarak dari penanda ke sasaran.
Kesan DNA tak terkandung
Walking kromosom boleh dihentikan oleh serpihan DNA yang tidak terkumpul.	Nota piccolos yang paling rendah boleh dimainkan adalah D_4.
Perlu untuk Sequence yang Dikenali
Proses ini bermula dengan gen yang dikenali berhampiran sasaran.	Proses ini memerlukan fragmen yang diketahui untuk merancang buku asas.

Ringkasan - Chromosome Walking vs Jumping

Walking kromosom sering diterapkan apabila diketahui bahawa gen tertentu terletak berhampiran dengan gen sebelumnya yang diklonkan dalam kromosom dan ia mungkin untuk mengenal pasti dengan mengulang pengasingan klon genomik berdekatan dari perpustakaan genomik. Walau bagaimanapun, apabila kawasan DNA berulang dijumpai semasa teknik berjalan kromosom, proses itu tidak dapat diteruskan. Oleh itu, teknik itu pecah dari titik itu. Melompat kromosom adalah alat biologi molekul yang mengatasi had ini untuk pemetaan genom. Ia memintas kawasan DNA berulang ini yang sukar diklon dan membantu pemetaan fizikal genom. Ini adalah perbezaan utama antara kromosom berjalan dan melompat.

Rujukan:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa, dan Mitsuhiro Yanagida. "Kromosom berjalan menunjukkan turutan berulang yang sangat homolog yang hadir di semua kawasan centromere yis pembelahan." Jurnal EMBO. Perpustakaan Perubatan Negara A.S., Mei 1986. Web. 22 Mac 2017
2. Taheri, Ali. "Kromosom berjalan dan melompat." Kemajuan Kejuruteraan Genetik. OMICS International, 30 Okt. 2013. Web. 22 Mac 2017

Sains & Alam