Perbezaan Antara Klon dengan Sequencing Clone dan Sequin Gun

The perbezaan utama antara klon dengan penjujukan klon dan urutan senapang patah terletak pada kaedah kelakuan mereka. Klon dengan kaedah penjujukan klon melibatkan pemetaan kromosom dan pengklonan sebelum penjujukan sementara klon dengan penjujukan senapang patah menghilangkan kedua-dua pemetaan kromosom dan langkah pengklonan semasa penjujukan.

Klon dengan penjujukan klon dan klon dengan penjujukan senapang patah adalah dua kaedah penjujukan genom moden. Klon dengan penjujukan klon adalah kaedah penjujukan yang lebih dipercayai. Walau bagaimanapun, kaedah klon dengan penjujukan senapang patah lebih cepat dan lebih murah. Artikel ini memberi tumpuan kepada perbezaan halus antara klon dengan penjujukan klon dan penjejakan senapang patah.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Clone dengan Clone Sequencing 
3. Apakah Clone oleh Sequin Gun
4. Kesamaan Antara Klon dengan Sequencing Clone dan Sequin Shotgun
5. Side by Side Comparison - Clone by Clone Sequencing vs Sequencing Sequencing in Form Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Clone oleh Clone Sequencing?

Klon dengan penjujukan klon adalah kaedah penjujukan genom. Ia memerlukan pemetaan setiap kromosom sebelum pemisahan DNA. Setelah pemetaan, DNA harus dipecah menjadi serpihan 150 kilobases panjang. Serpihan ini kemudiannya siap untuk urutan. Langkah seterusnya adalah penyisipan serpihan DNA ke dalam Chromosome Buatan Buatan (BAC) dan kemudian ke dalam sel bakteria. Oleh kerana serpihan kini berada di dalam sel bakteria, setiap kali bakteria membahagikan, serpihan DNA yang dimasukkan juga membahagikan dan menghasilkan banyak salinan yang serupa. Kemudian, DNA klon bakteria individu dipecah menjadi 500 asas pasangan serpihan panjang. Mereka adalah lebih kecil dan serpihan bertindih. Seterusnya, penjujukan berlaku dengan penyisipan serpihan ini menjadi vektor dengan urutan DNA yang diketahui. Bermula dari urutan vektor yang diketahui, penjujukan berterusan sehingga urutan yang tidak diketahui.

Selepas menyelesaikan urutan, perlu mengenal pasti bahagian-bahagian urutan bertindih. Selepas itu, serpihan serangkai dilakukan untuk membentuk serpihan yang lebih besar yang mula-mula dibentangkan dalam BAC. Seterusnya, pemasangan serpihan yang lebih besar ke dalam kromosom berlaku mengikut peta genom.

Rajah 01: Klon dengan Penggolongan Klon

Kelebihan penting klon dengan penjujukan klon adalah bahawa peta genom yang disediakan sebelum ini membantu pemasangan fragmen yang lebih besar. Namun, kelemahan kaedah penjujukan ini adalah memakan masa untuk menghasilkan peta genom dan membuat klon. Walau bagaimanapun, ini adalah kaedah yang disukai semasa 'Projek Genom Manusia'.

Apa itu Clone oleh Sequencing Shotgun?

Clone oleh sequencing shotgun adalah kaedah penjujukan yang secara rawak memecah urutan DNA ke dalam banyak serpihan kecil dan menyusun semula urutan dengan memerhati kawasan bertindih. Genom mamalia yang lebih besar adalah sukar untuk mengklonkan urutan dan memasang. Ini disebabkan oleh kerumitan dan saiz strukturnya. Walaupun klon dengan kaedah penjujukan klon boleh dipercayai, ia mengambil masa yang lama untuk menyusun genom organisma kompleks. Oleh itu, klon dengan urutan senapang patah telah menjadi kaedah penjujukan yang lebih murah yang dapat dilakukan dengan lebih cepat. Oleh itu, para saintis moden bergantung pada kaedah penjujukan ini untuk menangani genom kompleks.

Rajah 02: Klon dengan Sequencing Shotgun

Semasa klon dengan kaedah penjujukan senapang patah, tiada pemetaan genom konvensional dan langkah pengklonan berlaku. Pada mulanya, seluruh genom dipecahkan kepada pelbagai saiz dari 20 kilobases hingga 300 kilobases. Seterusnya, penjujukan berlaku. Kemudian, dengan menggunakan perisian komputer yang canggih, adalah perlu untuk memasang serpihan dengan melihat kawasan bertindih.

Klon dengan penjujukan senapang patah membantu meningkatkan ketepatan urutan genom sedia ada. Kelebihan utama kaedah ini adalah bahawa ia adalah lebih cepat dan lebih murah daripada klon dengan kaedah penjujukan klon. Walau bagaimanapun, proses ini tidak melibatkan penggunaan peta genetik. Oleh itu, kesilapan semasa perhimpunan lebih cenderung berlaku. Oleh itu, ini adalah kelemahan utama dalam klon dengan kaedah penjujukan senapang patah.

Apakah Kesamaan Antara Klon dengan Sequencing Clone dan Sequin Gun?

• Kedua-dua klon dengan penjujukan klon dan urutan senapang patah adalah dua kaedah penjujukan genom.
• Semasa kedua teknik penjujukan, pemasangan pecahan pecah dilakukan dengan mengenal pasti kawasan bertindih.
• Juga, pecahan DNA ke dalam serpihan yang lebih kecil adalah perlu untuk penjujukan klon dan senapang patah.

Apakah Perbezaan Antara Klon dengan Sequencing Clone dan Sequin Shotgun?

Klon dengan teknik penjujukan klon melibatkan dua langkah utama: pemetaan kromosom dan pengklonan. Sebaliknya, klon dengan penjujukan senapang patah tidak mengikuti kedua-dua langkah ini; ia secara rawak memecah urutan DNA ke dalam serpihan kecil dan menyusun semula urutan dengan memerhatikan kawasan bertindih. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara klon dengan penjujukan klon dan urutan senapang patah. Oleh sebab faktor ini, klon dengan penjujukan klon adalah proses yang mahal dan memakan masa manakala klon dengan urutan senapang patah lebih cepat dan lebih murah.

Walau bagaimanapun, ralat semasa pemasangan kurang berkemungkinan berlaku semasa klon dengan penjujukan klon. Oleh itu, ia mempunyai kebolehpercayaan yang tinggi. Walau bagaimanapun, klon dengan penjujukan senapang patah adalah teknik yang kurang dipercayai. Oleh itu, ini juga merupakan perbezaan yang signifikan antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah.

Grafik maklumat di bawah ini membentangkan lebih banyak maklumat mengenai perbezaan antara klon dengan penjujukan klon dan penjujukan senapang patah.

Ringkasan - Klon dengan Penggolongan Clone vs. Sequencing Shotgun

Dalam meringkaskan perbezaan antara klon dengan penjujukan klon dan urutan senapang patah, klon dengan penjujukan klon dan urutan senapang patah adalah dua kaedah penjujukan genom. Walau bagaimanapun, klon dengan teknik penjujukan klon melibatkan kedua-dua pemetaan genom dan proses kloning sementara klon dengan penjujukan senapang patah tidak. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara klon dengan penjujukan klon dan urutan senapang patah. Oleh kerana pemetaan genom berlaku semasa klon dengan penjujukan klon, ralat kurang berkemungkinan berlaku semasa pemasangan urutan. Tetapi, klon dengan penjujukan senapang patah adalah proses yang lebih cepat dan lebih murah. Namun, ia agak kurang dipercayai. Klon dengan penjujukan klon adalah kaedah penjujukan pilihan dalam 'Projek Genom Manusia'. Tetapi, ahli biologi molekul moden bergantung lebih banyak pada klon dengan penjejakan senapang patah.

Rujukan:

1. "Apakah Sequencing Clone-by-Clone?" Fakta, Pasukan Penglibatan Awam di Kampus Genome Wellcome, 17 Nov 2014, tersedia di sini.
2. "Apakah Urutan Seismik?" Fakta, Pasukan Penglibatan Awam di Kampus Genome Wellcome, 17 Nov 2014, tersedia di sini.

Image Courtesy:

1. "Langkah-langkah Pengklonan Molekul" Oleh Alexpicardal97 - Kerja sendiri, CC BY-SA 4.0) melalui Wikimedia Commons
2. "Susunan bendera lg" oleh Institut Penyelidikan Genom Manusia Kebangsaan - Institut Kesihatan Nasional. Institut Penyelidikan Genom Manusia Kebangsaan. "Bercakap Glosari Syarat genetik." Diperoleh pada 17 November 2016 (Public Domain) melalui Wikimedia Commons