Perbezaan Antara Exome dan Transkrip

Perbezaan Utama - Exome vs Transkrip
 

Satu gen mengandungi kawasan pengekodan dan bukan pengekodan di dalamnya. Urutan pengekodan dikenali sebagai exon, dan urutan bukan pengekodan dikenali sebagai intron. Urutan nucleotide dari exon gen mewakili kod genetik gen untuk mensintesis protein spesifik. Oleh itu, exon kekal dalam molekul mRNA. Keseluruhan wilayah exon genom ini dikenali sebagai exome, dan ia merupakan bahagian penting dalam genom. Kod genetik gen diubah menjadi kod genetik molekul mRNA, yang diperlukan untuk menghasilkan protein. Seluruh molekul mRNA yang ditranskripsikan dalam sel atau populasi sel pada satu masa dikenali sebagai transkrip. Perbezaan utama antara exome dan transkrip adalah exome mewakili urutan kawasan ekson genom sementara transkrip mewakili total mRNA sel atau tisu pada masa yang diberikan.

KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Exome
3. Apakah Transkrip
4. Side by Side Comparison - Exome vs Transcriptome
5. Ringkasan

Apa itu Exome?

Gen terdiri daripada exon, intron dan urutan peraturan. Tanda-tanda adalah kawasan-kawasan gen yang ditranskripsikan ke dalam urutan mRNA semasa transkripsi. Introns dan kawasan bukan pengekodan lain dikeluarkan semasa transkripsi. Urutan nucleotide ekson menentukan kod genetik gen yang mensintesis protein spesifik kod itu. Hanya exon yang tinggal dalam mRNA protein. Pengumpulan exon dalam genom dikenali sebagai exome dari organisma. Ia mewakili sebahagian daripada genom yang dinyatakan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ia adalah bahagian protein pengekodan genom manusia.

Rajah 01: Exome

Apa itu Transkrip?

Transkrip adalah pengumpulan semua transkrip pengekodan protein dan pengekodan (RNA) protein dalam tisu tertentu. Transkrip mewakili koleksi molekul total mRNA yang dinyatakan oleh gen dalam sel atau tisu. Transkrip sel boleh diubah dengan transkrip jenis sel yang lain. Transkrip ini juga dinamik - ia berubah dengan masa sebagai tindak balas kepada rangsangan dalaman dan luaran. Walaupun dalam tisu yang sama atau dalam jenis sel yang sama, transkrip boleh berubah selepas beberapa minit.

Transkrip adalah berbeza daripada organisme. Transkrip hanya termasuk urutan exome yang dinyatakan. Walaupun exome sel tetap sama, transkrip berbeza di antara sel-sel kerana ungkapan gen tidak sama untuk semua sel atau tisu. Hanya gen penting yang dinyatakan dalam sel dan tisu yang berlainan. Ekspresi gen adalah tisu atau proses khusus jenis sel. Ia dikawal oleh pelbagai faktor termasuk faktor persekitaran. Oleh itu, transkrip boleh berbeza dengan keadaan persekitaran luaran.

Transkrip digunakan sebagai pendahulu untuk kajian proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Pengubahsuaian translasi boleh menyebabkan perubahan dalam protein. Walau bagaimanapun, transkrip menyediakan maklumat asas yang penting untuk kajian-kajian proteomik.

Rajah 02: Transkrip sel-sel stem embrio

Apakah perbezaan antara Exome dan Transkrip?

Exome vs Transkrip
Exome adalah pengumpulan gen pengkodan protein gen.	Transkrip adalah pengumpulan semua RNA yang disalin termasuk mRNA.
Contoh
Exome dikaji menggunakan sampel DNA.	Transkrip boleh dikaji menggunakan sampel RNA.
Kaedah Kajian
Penjujukan exome keseluruhan adalah kaedah belajar exome.	Urutan RNA adalah kaedah belajar transkrip.

Ringkasan - Exome vs Transkrip

Exon adalah urutan pengekodan gen dan menentukan urutan mRNA protein. Pengumpulan urutan pengekodan (exons) ini dikenali sebagai exome dari organisma. Gen ditranskrip ke dalam molekul mRNA sebelum membuat protein. Molekul molekul keseluruhan sel atau tisu pada satu masa tertentu dikenali sebagai transkrip. Transkrip mewakili gen yang sedang aktif diungkapkan ke dalam mRNA pada bila-bila masa. Transkrip adalah sel dan tisu khusus dan memberi kesan kepada keadaan persekitaran. Ini adalah perbezaan di antara exome dan transkrip.

Rujukan:
1.Sarah et al, "Tangkapan Berjangkit dan Sequencing Selari Massal Dua Puluh Manusia." Alam. Perpustakaan Perubatan Negara A.S., 10 Sept. 2009. Web. 01 Apr. 2017
2.Mutz et al. "Analisis transkrip menggunakan penjujukan generasi akan datang." Elsevier: Pencari Artikel. N.p., Sept. 2012. Web. 01 Apr. 2017

Image Courtesy:
1. "Transkrip sel-sel pluripotent" oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkrip teks pluripotent (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komuniti Penyelidikan Stem Cell, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. - [1] DirectStemBook Rajah 2 Transkrip pluripotent cells.Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., Transkrip teks pluripotent (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komuniti Penyelidikan Stem Cell, StemBook, doi / 10.3824 / stembook.1.24.1, (CC BY 3.0) melalui Wikimedia Commons