Perbezaan antara IKAN dan CGH

The perbezaan utama antara IKAN dan CGH itu IKAN adalah teknik molekul yang mengesan urutan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluorescently, sementara CGH adalah teknik sitogenetik molekul lain yang mengesan perubahan dalam DNA genomik.

Analisis Cytogenetic memainkan peranan yang penting dalam perubatan ketika mengesan keabnormalan kromosom seperti aneuploidies, penghapusan, duplikasi, dan susunan semula, dan lain-lain. Keabnormalan kromosom akhirnya membawa kepada penyakit genetik seperti kanser, kemandulan, sindrom Down, sindrom Klinefelter, Sindrom Turner, leukemia, dll Terdapat pelbagai kaedah sitogenetik molekul untuk mengesan kecacatan dan penyakit yang disebut di atas. Antaranya, FISH (hibridisasi inovatif di situ) dan CGH (perbandingan hibrid genomik) adalah dua teknik hibridisasi yang kuat. Walau bagaimanapun, kedua-dua kaedah mempunyai kebaikan dan keburukan.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah IKAN 
3. Apakah CGH
4. Persamaan Antara IKAN dan CGH
5. Side by Side Comparison - IKAN vs CGH dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apa itu IKAN??

IKAN adalah teknik hibridisasi asid nukleik yang dilakukan pada bahagian atau bahagian tisu, di seluruh tisu atau sel. Ia adalah kaedah berasaskan probe. Teknik ini bergantung kepada teori pasangan asas pelengkap Watson Crick, menghasilkan sama ada DNA - hibrida DNA atau hibrida DNA - RNA, yang dapat mengesan gen mutasi atau dapat mengenal pasti gen yang menarik. Selain itu, teknik ini menggunakan urutan DNA terkandas tunggal, urutan DNA dua stranding, urutan RNA tunggal terkandas atau oligonukleotida sintetik yang disediakan menggunakan terjemahan nick sebagai probe yang melengkapi urutan gen yang menarik. Selain itu, ciri yang paling penting dalam teknik ini ialah pelabelan probe dengan pewarna pendarfluor. Oleh itu, probe mengikat dengan bahagian pelengkap kromosom dan memudahkan pengesanan.

Selain itu, IKAN adalah kaedah yang sangat sensitif dan khusus. Oleh itu, ia adalah satu teknik biasa dalam kedua-dua penyelidikan dan diagnosis keganasan hematologi dan tumor pepejal. Tetapi, IKAN menunjukkan resolusi rendah. Ia juga memerlukan pengetahuan terlebih dahulu tentang kelainan sasaran untuk merancang urutan siasatan.

Rajah 01: IKAN

Terdapat banyak aplikasi IKAN, terutamanya dalam diagnostik molekul penyakit berjangkit untuk mengenal pasti kehadiran patogen dan mengesahkan patogen melalui diagnostik molekul. Selain itu, FISH adalah teknik yang biasa digunakan dalam bidang biologi perkembangan, analisis karyotyping dan phylogenetic dan pemetaan fizikal kromosom.

Apakah CGH itu?

Hibridisasi genomik perbandingan (CGH) adalah satu lagi teknik sitogenetik molekul berasaskan DNA yang dapat mengesan perubahan urutan DNA genomik. Kaedah ini merupakan kaedah maju yang boleh menganalisis kromosom dan pengubahsuaian gen untuk mengesan perubahan atau perubahan dalam urutan DNA genomik. Selanjutnya, CGH memerlukan pengasingan dan pemecahan DNA dari sampel percubaan dan sampel rujukan. Kemudian, sampel hendaklah dilabelkan menggunakan dua pewarna pendarfluor berbeza (biasanya merah dan hijau). Kemudian, kedua-dua sampel bercampur dan dibenarkan untuk hibridisasi kompetitif. Langkah terakhir ialah analisis sampel bagi perubahan dalam DNA seperti pertindihan gen, kehilangan gen, dan sebagainya. Secara khususnya, ia mengukur perbezaan nombor salinan DNA antara sampel ujian dan sampel kawalan.

Rajah 02: CGH

Satu lagi versi CGH boleh didapati sekarang; ia adalah kaedah yang lebih maju daripada CGH biasa. Ia adalah teknik yang dipanggil berasaskan CGH atau aCGH. aCGH membolehkan identifikasi tepat gen atau penghapusan urutan dalam beribu-ribu urutan dalam satu percubaan tunggal.

Apakah Kesamaan Antara IKAN dan CGH?

• IKAN dan CGH adalah dua teknik molekul.
• Kedua-dua IKAN dan CGH bergantung kepada hibridisasi asid nukleik.
• Selain itu, kedua-dua teknik memerlukan probe yang direka untuk mengesan sasaran DNA tertentu.
• Kami menggunakannya untuk diagnosis penyakit genetik sebelum dan selepas lahir.
• Tambahan pula, IKS dan CGH adalah alat yang sangat kuat untuk mengkaji perubahan genomik.
• Mereka menggunakan pewarna pendarfluor untuk menanda probe.

Apakah Perbezaan Antara IKAN dan CGH?

IKAN adalah in situ Prosedur hibridisasi yang menggunakan probe fluorescent untuk mengesan urutan DNA tertentu, sedangkan CGH adalah teknik hibridisasi molekul yang mengesan perubahan urutan DNA genomik. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara IKAN dan CGH.

Selain itu, IKAN memerlukan pengetahuan terlebih dahulu mengenai kelainan sasaran untuk merancang urutan siasatan, sementara CGH tidak memerlukan pengetahuan terlebih dahulu. Juga, perbezaan selanjutnya antara IKAN dan CGH ialah IKAN menunjukkan resolusi terhad sementara aCGH menunjukkan resolusi tinggi.

Di bawah infographic meringkaskan perbezaan antara IKAN dan CGH.

Ringkasan - IKAN vs CGH

IKAN dan CGH adalah dua teknik sitogenetik molekul yang memudahkan pengesanan urutan gen yang menarik. IKAN memudahkan pengesanan jujukan DNA spesifik pada kromosom menggunakan probe berlabel fluorescently sementara CGH memudahkan pengesanan pengubahan DNA genomik. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara IKAN dan CGH.

Rujukan:

1. "Pendarfluor dalam Hibridisasi Situ (IKAN)" Berita Alam, Kumpulan Penerbitan Alam, Boleh didapati di sini.
2. Hester, Susan D, et al. "Perbandingan Teknologi Hibridisasi Genomik Perbandingan merentas Platform Mikararray." Jurnal Teknik Biomolekul: JBT, Persatuan Kemudahan Sumber Biomolekul, Apr. 2009, Boleh didapati di sini.

Image Courtesy:

1. "Multiplex ViewRNA Assay di Jurkat dan sel HeLa" oleh Ryan Jeffs - Kerja sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons
2. "Skema CGH" Oleh Mbaudis (perbincangan) (Muat naik) - Kerja sendiri (CC BY 2.5) melalui Wikimedia Commons