Perbezaan Antara DNA Genomik dan Pengasingan DNA Plasmid

The perbezaan utama antara genomik DNA dan pengasingan DNA plasmid adalah bahawa pengasingan DNA genomik mensasarkan pengekstrakan DNA genomik sementara pengasingan DNA plasmid mensasarkan pengekstrakan DNA plasmid bakteria.

Pengasingan DNA adalah proses kimia yang digunakan untuk mengasingkan DNA dari spesies yang berbeza atau dari sampel yang berbeza. Pengasingan DNA adalah penting dalam teknik biologi molekul hiliran, seperti elektroforesis gel, tindak balas rantai polimerase dan teknik penjujukan DNA. Oleh itu, pengasingan DNA merupakan proses kimia penting dalam kajian biologi molekul. Berdasarkan tujuan penyelidikan, kadang-kadang perlu untuk mengasingkan DNA genomik. Di samping itu, beberapa kajian memberi tumpuan kepada mengasingkan DNA plasmid daripada bakteria. Pengasingan DNA genom adalah proses mengasingkan DNA genomik dari sampel prokaryotik atau eukariotik. Langkah-langkah pengasingan berbeza mengikut jenis sel di mana DNA mengasingkan. Pengasingan DNA plasmid adalah proses mengasingkan DNA plasmid dari sel bakteria. Berbanding dengan pengasingan DNA genomik, proses keseluruhannya kompleks dalam pengasingan DNA plasmid.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Pengasingan DNA Genomik
3. Apakah Pengasingan DNA Plasmid
4. Kesamaan Antara DNA Genomik dan Pengasingan DNA Plasmid
5. Side by Side Comparison - DNA Genomic vs Plasma Isolation Isolation in Form Tabular
6. Ringkasan

Apakah Pengasingan DNA Genomik?

Pengasingan DNA genom adalah proses pengekstrakan DNA genomik seluruh organisma. Proses khusus ini melibatkan tiga peristiwa utama. Mereka adalah, lisis sel atau lisis nuklear, degradasi protein atau proteolisis dan pemendakan DNA genomik. Langkah lisis mungkin berbeza mengikut jenis sel. Dalam prokariot, kerana terdapat dinding sel peptidoglycan, langkah pertama harus menjadi pecahan dinding sel. Sebaliknya, dalam eukariota, langkah lisis melibatkan pecahan membran plasma dan membran nuklear untuk mengeluarkan DNA ke bahagian luar. Sebaliknya, langkah khas adalah penting untuk melengkapkan dinding sel tumbuhan dan kulat.

Rajah 01: Pengasingan DNA Genomik

Akibatnya, apabila langkah lisis selesai, akhirnya DNA akan datang ke supernatan. Pada masa yang sama, degradasi protein juga berlaku dalam larutan kerana penambahan proteinase K. Langkah seterusnya adalah untuk memisahkan DNA genomik dan protein yang terdegradasi dari satu sama lain. Oleh itu, protein yang terdegradasi memisahkan oleh pemendakan yang membolehkan DNA genomik kekal dalam supernatan. Selepas pemendakan protein, DNA genomik boleh dicetuskan dan ditangguhkan semula dalam penampan yang sesuai sehinggalah ia memerlukan eksperimen.

DNA genom, yang merupakan DNA linear mengandungi semua maklumat genetik organisma. Dengan kata lain, genom adalah bahan keturunan organisme hidup yang bertanggungjawab untuk semua aktiviti struktur dan fungsi sel. Ia terdiri daripada kedua-dua coding dan bukan cetakan urutan DNA. Apabila mengasingkan DNA genomik, ia merangkumi seluruh genom organisma.

Apakah Pengasingan DNA Plasmid??

Pengasingan DNA plasmid adalah proses pengasingan DNA yang khusus dan lebih rumit. Plasmid adalah DNA extrachromosomal yang terdapat di kebanyakan sel bakteria. Mereka adalah DNA pekeliling yang tidak aktif yang menyokong bakteria untuk bertahan dalam keadaan alam sekitar yang keras. DNA plasmid terdiri daripada gen tahan khas yang memberikan kelebihan tambahan kepada bakteria seperti rintangan antibiotik, sifat-sifat virulensi dan sifat toksik.

Rajah 02: Pengasingan DNA Plasmid

Pengasingan DNA Plasmid juga melibatkan tiga proses utama; lisis sel, proteinolisis dan curah hujan DNA. Walaupun mekanisme pengasingan biokimia adalah serupa dengan pengasingan DNA genomik, prosesnya lebih kompleks daripada itu. Proses lisis sel adalah proses yang paling penting dalam prosedur ini. Paling penting, DNA genom dan DNA plasmid tidak boleh bercampur-campur dengan satu sama lain. Oleh itu, proses lisis yang lebih ringan menggabungkan ke dalam prosedur pengasingan DNA plasmid. Oleh itu, kebanyakan prosedur pengasingan DNA plasmid menggunakan detergen; natrium dodekil sulfat untuk lisis sel.

Apakah Kesamaan Antara DNA Genomik dan Pengasingan DNA Plasmid?

• Tumpuan DNA genom dan DNA Plasmid tumpuan untuk mengekstrak DNA daripada organisma.
• Juga, kedua-duanya mengikuti proses keseluruhan yang sama termasuk lisis sel, degradasi protein dan pemendakan DNA.
• Tambahan pula, menghasilkan kedua-dua proses DNA adalah penting untuk proses hiliran.
• Selain itu, kedua-dua proses pengasingan termasuk langkah-langkah untuk membersihkan dan menyimpan DNA di bawah syarat simpanan tertentu.
• Selain itu, proteinase K digunakan dalam kedua-dua kaedah untuk menurunkan protein.

Apakah Perbezaan Antara DNA Genomik dan Pengasingan DNA Plasmid?

Pengasingan DNA genomik difokuskan pada penggalian seluruh DNA genomik organisma sasaran manakala pengasingan DNA plasmid memfokuskan pada mengasingkan DNA plasmid daripada spesies bakteria tertentu. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid. Selain itu, satu lagi perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid adalah dalam prosedur. Pengasingan DNA genomik adalah prosedur yang kurang kompleks berbanding pengasingan DNA plasmid. Oleh itu, apabila mengasingkan DNA plasmid, perlu mengambil langkah berjaga-jaga untuk mencegah pencampuran DNA genomik dan plasmid antara satu sama lain.

Infograohic di bawah ini memberikan butiran lanjut tentang perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid.

Ringkasan - Pengasingan DNA DNA genomik vs Plasmaid

Pengasingan DNA adalah proses penting dalam teknik biologi molekul. Terdapat dua jenis DNA iaitu DNA genomik dan DNA plasmid (DNA tambahan-kromosom). Berdasarkan keperluan, beberapa prosedur dijalankan untuk mengasingkan DNA genomik sementara beberapa prosedur memberi tumpuan untuk mengasingkan DNA plasmid daripada bakteria. Oleh itu, langkah-langkah yang terlibat dalam kedua-dua proses berbeza sedikit daripada satu sama lain. Walau bagaimanapun, proses keseluruhan adalah sama dalam kedua-dua pengasingan. DNA terisolasi kedua-dua proses mempunyai penggunaan yang sangat besar dalam proses hiliran seperti kloning, elektroforesis gel dan reaksi rantai polimerase. Pada akhir protokol pengasingan DNA genom, seluruh DNA genomik organisma boleh diasingkan sebagai produk akhir sementara pada akhir protokol pengasingan DNA plasmid, DNA plasmid bakterium masing-masing boleh diasingkan sebagai produk akhir. Oleh itu, ini adalah perbezaan antara DNA genomik dan pengasingan DNA plasmid.

Rujukan:

1. "EXTRACTION DNA DARI BACTERIA." Pengekstrakan DNA dari Bakteria. Terdapat di sini 

Image Courtesy:

1. "Pengekstrakan DNA" Oleh Joo Nath - Kerja sendiri, (CC BY-SA 4.0) melalui Wikimedia Commons 
2. "Plasmid miniprep" Oleh Retama - Kerja sendiri, (CC BY-SA 4.0) melalui Wikimedia Commons