Perbezaan Antara Genotyping dan Sequencing

Perbezaan Utama - Genotyping vs Sequencing
 

Genotyping dan urutan adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan maklumat mengenai asid nukleik, terutamanya DNA dari suatu organisma. Perbezaan utama antara genotyping dan urutan adalah bahawa genotip adalah proses menentukan varian genetik mana individu yang menggunakan penanda sementara penjujukan adalah penentuan susunan urutan yang betul dalam nukleotida dalam fragmen DNA yang diberikan.

KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Genotyping
3. Apakah urutan
4. Side by Side Comparison - Genotyping vs Sequencing
5. Ringkasan

Apa itu Genotyping?

Genotyping adalah penentuan ciptaan genetik seorang individu menggunakan urutan DNA dan penanda dan perbandingan dan pengenalpastian warisannya. Genotyping adalah penting dalam biologi evolusi, biologi populasi, taksonomi, ekologi, dan genetik organisma. Ia boleh dilakukan dengan teknik yang berbeza termasuk penjujukan DNA, tindak balas rantai polimerase, polimorfisme panjang pecahan pecahan (RFLP), pengesanan polimorfik rawak yang diperkuat, menguatkan polimorfisme panjang serpihan (AFLP), microarray DNA, dan sebagainya.

Genotyping melibatkan penjujukan serpihan kecil tertentu urutan DNA dan mencari keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain yang menggunakan penanda genetik. Ia menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) di kalangan individu atau alel spesifik. Genotyping boleh digunakan untuk pelbagai organisma termasuk manusia. Ia juga boleh digunakan untuk mikroorganisma seperti virus, kulat dan lain-lain dan boleh digunakan untuk menentukan varian genetik mereka dengan profil rujukan. Dalam epidemiologi molekul dan mikrobiologi forensik, mengawal patogen, terutama mikroorganisma, dilakukan oleh maklumat yang diperoleh daripada genotip. Genotyping sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia genotip untuk mengesahkan keibuan dan kehamilan. Genotype akan mendedahkan alel yang dominan dan resesif gen yang menentukan ciri-ciri tertentu.

Figure_1: Genotyping RFLP

Apa urutannya?

Sequencing adalah proses menentukan susunan nukleotida yang betul dalam fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Hampir semua maklumat yang diperlukan untuk pertumbuhan dan perkembangan organisma dikodkan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk menghasilkan dan memisahkan beberapa ratus nukleotida serpihan asid nukleik yang panjang menyebabkan perkembangan prosedur menentukan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Kaedah penjujukan pelbagai jenis boleh didapati pada hari ini. Kaedah penjujukan ini, bersama-sama dengan teknologi untuk pembinaan perpustakaan genom yang mewakili keseluruhan genom organisma, memudahkan penjujukan seluruh genom organisma itu, membuat analisa mendalam struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, kawasan pengawalseliaan gen dan lain-lain.

Jumlah genom banyak virus, beberapa bakteria, archaebacteria, yis dan beberapa organisma lain telah disusun dan dipetakan. Projek genom manusia telah memungkinkan untuk menjejaki dan memetakan keseluruhan genom manusia dan menerbitkan draf pertama pada tahun 2003. Ini adalah pencapaian utama dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia kini digunakan dalam sektor perubatan untuk mengenal pasti punca-punca genetik untuk penyakit jarang berlaku, risiko penyakit skrin pada bayi yang baru lahir, mengenalpasti butiran genetik kanser yang berbeza, membangun terapeutik baru, dan membangunkan alat diagnostik baru, dan lain-lain.

Di dunia tumbuhan, genom beras dan genom Arabidopsis telah disusun. Pengetahuan tentang urutan ini pasti akan merevolusikan pemahaman kita tentang bagaimana fungsi sel dan organisma.

Figure_2: Satu autoradiograph pengurutan yang penuh

Apakah perbezaan antara Genotyping dan Sequencing?

Genotyping vs Sequencing
Genotyping adalah proses menentukan komposisi genetik individu dan memeriksa kumpulan atau taksonomi organisma itu.	Sequencing adalah proses menentukan susunan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan.
Teknik
RFLP, penjujukan gen, PCR, microarrays DNA, AFLP dan sebagainya.	Penjujukan Sanger, penjujukan Gilbert, Pyrosequencing, Penjelmaan Generasi Seterusnya, urutan penjejakan dan sebagainya.
Kebimbangan Utama
Ini lebih membimbangkan sama ada perbezaan genotip memberikan perbezaan fenotip sebenar.	Ini lebih mempedulikan susunan nukleotida dan perbezaannya dan perubahan dengan organisma lain.

Ringkasan - Genotyping vs Sequencing

Genotyping dan penjujukan adalah berguna untuk mengkaji maklumat genetik organisma. Genotyping adalah proses menentukan variasi genotype di kalangan individu dan mencari kategori mereka. Urutan adalah proses menentukan urutan nukleotida yang betul dalam serpihan yang berminat atau rantau DNA. Kedua-dua teknik memberikan maklumat penting mengenai gen dan genom.

Rujukan:
1. "Kaedah genotip." Kaedah dalam biologi molekul (Clifton, N.J.). Perpustakaan Perubatan Negara A.S., n.d. Web. 20 Feb. 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin, dan M. D. Shriver. "Analisis Curve Melting SNPs (McSNP ): Pendekatan Gel Percuma dan Tidak Murah untuk Genotyping SNP." BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. Web.

Image Courtesy:
1. "Genotyping RFLP" Oleh (tidak diketahui) - Institut Kesihatan Nasional (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2. "Fluorescent Radioaktif" Oleh Abizar di Wikipedia Bahasa Inggeris (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons