The perbezaan utama antara GFP dan EGFP adalah bahawa GFP ialah sejenis protein liar yang dimasukkan dalam pengklonan molekul sel bukan mamalia manakala EGFP adalah sejenis GFP yang diperbaiki atau kejuruteraan yang boleh digunakan pada sel-sel mamalia.
Pengklonan molekul adalah teknik lanjutan yang digunakan para saintis dalam mengungkapkan protein melalui teknologi rekombinan. Dalam teknologi DNA rekombinan, diperlukan transformasi vektor rekombinan untuk menganjurkan organisma. Oleh itu, semasa proses transformasi, ia harus dikenal pasti dan disahkan sama ada gen minat telah berubah atau tidak kepada tuan rumah. Untuk menilai ini, ahli biologi molekul menggunakan beberapa teknik. Daripada teknik tersebut, ada pula wartawan gen. Gen wartawan ini bertindak sebagai penanda dipilih untuk memilih transformator yang betul. Oleh itu, Protein Pendarfluor Hijau (GFP) dan Enhanced Green Fluorescent Protein (EGFP) adalah dua protein reporter yang digunakan dalam pengklonan molekul.
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah GFP
3. Apakah EGFP itu
4. Persamaan Antara GFP dan EGFP
5. Perbandingan Side by Side - GFP vs EGFP dalam Borang Tabular
6. Ringkasan
GFP adalah sejenis protein liar yang mengandungi 238 residu asid amino dan beberapa kawasan asid amino yang boleh dipilih yang membezakannya daripada protein pendarfluor lain. Tambahan pula, protein jenis liar ini pada mulanya terpencil dari Aequorea Victoria; sejenis ubur-ubur. Walau bagaimanapun, dalam fenomena semulajadi, ubur-ubur mampu mengeluarkan pendarfluor warna hijau sebagai tindak balas kepada rangsangan tertentu.
Terdahulu, konsep ini mengejutkan saintis, dan mereka memutuskan untuk menggunakannya pada teknologi DNA rekombinan mereka. Akibatnya, saintis menggunakan bentuk mutant gen jenis liar sebagai gen reporter dalam kajian ekspresi gen mereka. Gen jenis liar GFP mampu menghasilkan protein yang memberikan pendarfluor pada suhu bilik atau di bawah cahaya UV. Oleh itu, apabila dimasukkan ke dalam transformator, ia menyatakan dan menghasilkan pendarfluor. Jika pendarfluor hasil selepas proses transformasi, ia mengesahkan kejayaan proses transformasi. Dalam kata yang mudah, pelepasan pendarfluaran memberi isyarat kepada transformasi yang berjaya dari vektor yang membawa gen yang menarik ke dalam tuan rumah.
Rajah 01: GFP
Kerana sebab ini, GFP bertindak sebagai dalam vivo penanda ekspresi gen. Pada masa ini, teknik kejuruteraan genetik digunakan untuk menghasilkan GFP. Juga, banyak versi GFP yang lebih baik seperti EGFP tersedia. Oleh itu, ini membolehkan penggunaan cekap GFP dalam kajian kloning dan ekspresi gen molekul.
Protein Pendarfluor Hijau yang Dipertingkatkan atau EGFP adalah versi GFP yang lebih baik. Secara ringkas, kita boleh menentukan EGFP sebagai versi kejuruteraan GFP jenis liar. Apabila gen gen jenis GFP bermutasi, ia menghasilkan kesan yang baik. Oleh itu, gen mutasi GFP membolehkan ungkapan aksara baru, dan akibatnya, kita boleh menghasilkan GFP Dipertingkatkan dengan ciri-ciri yang lebih baik. Tambahan pula, kita boleh memperkenalkan mutasi dengan berjaya ke gen GFP jenis liar menggunakan kaedah penyinaran atau kimia. Ini gen mutasi kemudian menghasilkan EGFP, yang mempunyai ciri-ciri yang lebih bermanfaat.
Rajah 02: EGFP
Ciri-ciri peningkatan EGFP adalah seperti berikut;
Oleh itu, berbanding dengan GFP, EGFP adalah pilihan utama untuk kajian ekspresi gen. Walau bagaimanapun, produk ini lebih mahal berbanding GFP.
Gen wartawan adalah gen yang melekat dengan gen yang menarik dalam teknologi DNA rekombinan. Ia menandakan transformasi vektor rekombinan yang berjaya kepada tuan rumah. Di sini, GFP dan EGFP adalah dua jenis protein hijau yang bekerja sebagai protein reporter. Walau bagaimanapun, perbezaan utama antara GFP dan EGFP ialah GFP adalah jenis liar manakala EGFP adalah versi kejuruteraan GFP. Selain itu, EGFP mempunyai lebih banyak ciri yang bermanfaat daripada GFP. Contohnya, EGFP menghasilkan cahaya pendarfluor yang lebih kuat dan lebih sensitif daripada GFP. Satu lagi perbezaan antara GFP dan EGFP adalah sistem di mana kita boleh menggunakannya. Sistem bukan mamalia menggunakan GFP sementara sistem mamalia menggunakan EGFP.
Infographic di bawah membentangkan perbezaan antara GFP dan EGFP dalam bentuk jadual.
GFP dan EGFP adalah protein reporter dalam mengkloning dan kajian ekspresi gen. GFP adalah protein jenis liar, yang merupakan protein neon hijau. Protein pada mulanya secara berasingan dari ubur-ubur Aequorea victoria. Sebaliknya, EFGP adalah bentuk protein GFP yang dipertingkatkan. Ia adalah mutant jenis liar dengan ciri-ciri yang lebih baik. Oleh itu, EFGP mempunyai kekuatan isyarat yang lebih tinggi dan sensitiviti yang lebih tinggi. Oleh itu, kita boleh menggunakannya pada vektor mamalia. Sebaliknya, penggunaan GFP terutamanya hanya pada vektor bukan mamalia. Secara keseluruhannya, ini adalah perbezaan antara GFP dan EGFP.
1.Cinelli, R A, et al. "Protein Pendarfluor Hijau Enhanced sebagai Alat untuk Analisis Dinamika Protein dan Penyetempatan: Kajian Pendarahan Tempatan di Tahap Satu-Molekul." Fotokimia dan Photobiology., Perpustakaan Perubatan Negara A.S., Jun 2000. Boleh didapati di sini
2. "PDB101: Molekul Bulan: Protein Pendarfluor Hijau (GFP)." RCSB: PDB-101. Terdapat di sini
1. "Filem Protein Fluorescent GFP" Oleh Erin Rod - Kerja sendiri, (CC BY-SA 4.0) melalui Wikimedia Commons
2. "CA2 amigo2 eGFP tetikus" Oleh Dudek, Serena; Kuantum, Douglas; Carstens, Kelly - Kerja sendiri, (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons