Perbezaan antara lophotrochozoa dan ecdysozoa, kedua-dua utama bilaterian, dibincangkan dalam artikel ini. Berdasarkan kajian baru-baru ini menggunakan urutan DNA nuklear dan mitokondria, saintis mengkaji semula taksonomi Kerajaan Haiwan. Menurut filogeni molekul baru, saintis mengenal pasti deuters sebagai kumpulan semula jadi yang berasingan. Selain itu, kumpulan utama protostom kini dibahagikan kepada dua kumpulan bilateral monophyletic yang dipanggil Lophotrochozoa dan Ecdysozoa. Oleh itu, Kerajaan Haiwan kini terdiri daripada tiga klise monophyletik utama haiwan dua hala; lophotrochozoa, ecdysozoa, dan deuterstomia. Dueterostomia clade dibahagikan kepada dua kumpulan kecil; (a) ambulakarya, yang termasuk echinoderms, dan (b) chordate, yang terdiri daripada urochordates, cephalochordates dan vertebrata. Lophotrochozoa dan ecdysozoa dibahagikan kepada lebih banyak kumpulan kecil berdasarkan filogene molekul mereka.
Ciri ciri lophotrochozoa kumpulan adalah kehadiran a larva trochophore dan struktur makan dipanggil lophophore. Walau bagaimanapun, hanya sedikit lophotrochozoans yang mempunyai kedua-dua ciri ciri ini. Lophotrochozoans disalin secara seksual dengan melepaskan gamet mereka ke alam sekitar. Pembiakan aseksual juga biasa dalam kategori ini. Setiap ahli kumpulan ini adalah triploblastik dan menunjukkan simetri dua hala. Kedua-dua spesies terestrial dan akuatik terdapat dalam kumpulan ini. Lophotrochozoa terbahagi kepada enam subkumpulan; (a) Flatworms (Platyhelminthes yang termasuk turbellarians, trematodes dan cestodes), (b) Nemerteans (cacing reben), Moluska (cita, gastropod seperti siput, slug, nudibranch, bivalves seperti kerang dan tiram, cephalopod seperti suntikan dan sotong (c) Annelids (polychaetes seperti cacing pasir dan tiub cacing, oligochaetes termasuk cacing tanah dan cacing air tawar, hirudinid, termasuk lintah), (d) Lophophorates (cabangipods, phoronids, dan bryozoans), dan (e) Rotifera.
Nama ecdysozoan diberikan kepada kumpulan haiwan ini kerana kehadiran hormon steroid khusus yang dipanggil ecdysteroids, yang mengawal proses dipanggil ecdisis atau metamorfosis. Ecdysozoans mempunyai kerangka cuticular dan dapat menumpahkan kerangka melalui ekdisis. Kebanyakan ahli dalam kumpulan ini mempunyai jantina berasingan. Semasa pembiakan seksual, lelaki sperma deposit di dalam tubuh wanita. Banyak ecdysozoans adalah spesies bersendirian, sementara beberapa spesies hidup di koloni. Spesies tertentu menunjukkan pembiakan aseksual melalui parthenogenesis.
Subkumpulan utama ekdysozoan termasuk nematodas (bulu bulu), onychophorans (cacing beludru), tardigrades ("air beruang"), dan arthropod. Phylum Arthropoda adalah kumpulan terbesar dengan jumlah spesies tertinggi dan terdiri terutamanya daripada myriapods (centipedes, millipedes), chelicerates (kepiting ladam, arachnids), crustaceans (lobster, ketam, terapung, copepods), dan hexapods (serangga).
• Ecdysozoans mempunyai keupayaan untuk melepaskan exoskeleton mereka beberapa kali sepanjang hayat mereka, sedangkan lophotrochozoan adalah binatang yang memiliki larva trochophore dan struktur makan yang disebut lophophore.
• Tidak seperti lophotrochozoan, ecdysozoans mempunyai hormon steroid khas yang disebut ecdysteroids.
• Ecdysozoa termasuk nematoda, arthropod, onychophorans, dan tardigrades, sedangkan lophotrochozoan termasuk flatworms, nemerteans, moluska, annelids, lophophorate, dan rotifer.