Metabolit adalah molekul kecil yang terlibat dalam reaksi metabolik dalam sel. Metabolit termasuk perantaraan metabolik, hormon, metabolit sekunder, molekul isyarat, dan sebagainya. Mereka adalah molekul berfungsi reaksi biokimia sel. Satu set metabolit lengkap sampel biologi atau satu organisma tunggal dikenali sebagai metabolit. Metabolom adalah koleksi dinamik yang berubah setiap saat di dalam badan. Metabolomik dan metabonomi adalah dua istilah yang berkaitan dengan kajian metabolit organisma. Perbezaan utama antara metabolomik dan metabolisme adalah bahawa metabolomik lebih peduli mengenai metabolisme endogen normal dan profil metabolik pada peringkat selular atau organ sementara metabonomi lebih berkaitan dengan memperluaskan profil metabolik dengan maklumat perturbasi metabolisme kerana faktor persekitaran, penyakit, mikroorganisma usus dan membandingkan profil metabolik, dan lain-lain. Metabolomik terutamanya didorong oleh spektrometri massa, dan metabonomi menggunakan spektroskopi NMR untuk analisis metabolit.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Metabolomik
3. Apakah Metabonomi
4. Side by Side Comparison - Metabolomics vs Metabonomics
5. Ringkasan
Metabolomik adalah kajian proses metabolik yang berlaku dalam sel, biofluid, tisu atau organisma. Ini termasuk pengenalpastian dan kuantifikasi metabolit selular menggunakan alat analisis dan statistik yang baik. Metabolomik dianggap sebagai kajian penting kerana ia mendedahkan maklumat mengenai metabolisme organisma.
Untuk mengkaji substrat dan produk reaksi metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis. Spektrometri massa mendedahkan jenis metabolit dan kepekatan mereka, mencerminkan keadaan biokimia sebenar sel atau tisu. Oleh itu, metabolomik boleh dianggap sebagai wakil terbaik fenotip molekul organisma. Metabolomik adalah teknologi omik molekul kecil organisma dan dibandingkan dengan kajian omik lain; metabolom adalah sangat penting kerana ia secara langsung mencerminkan status semasa reaksi biokimia sel.
Metabolomik juga boleh dianggap sebagai pelanjutan proteomik kerana ia dijana disebabkan oleh aktiviti-aktiviti enzim yang merupakan protein seperti ditunjukkan dalam angka berikut.
Rajah 01: Skim Metabolomik
Metabonomi ditakrifkan sebagai pengukuran kuantitatif respon metabolik multiparametrik pada masa-masa tertentu berkaitan dengan tegasan patofisiologi atau pengubahsuaian genetik. Ini biasanya digunakan untuk kajian mengenai pemakanan manusia dan tindak balas terhadap ubat-ubatan atau penyakit. Pendekatan ini dipelopori oleh Jeremy Nicholson di Imperial College, London dan ia telah digunakan dalam beberapa bidang termasuk toksikologi, diagnosis penyakit, pemakanan, dan lain-lain. Secara sejarah, metabonomi adalah salah satu kaedah pertama untuk menerapkan skop biologi sistem untuk kajian metabolisme.
Metabonomi lebih peduli dengan membandingkan profil biokimia daripada mengenal pasti sebatian metabolik individu dalam metabolomik. Oleh itu, metabonomi dapat ditakrifkan sebagai subset metabolomik. Ia terutamanya menekankan perbandingan profil metabolik populasi yang berbeza berkenaan dengan penyakit, tekanan alam sekitar, pengubahsuaian genetik, pemakanan, ubat-ubatan, dan sebagainya kerana metabolit adalah penanda yang baik yang memberi isyarat keadaan penyakit, kesan ubat, tekanan alam sekitar, pendedahan kepada toksin , dan lain-lain.
Kajian metabonomi menunjukkan kedua-dua metabolit intraselular dan ekstraselular. Ia menggunakan teknik pemprosesan tinggi untuk menganalisis sejumlah besar metabolit secara serentak dan berkali-kali, membolehkan siasatan sementara mengenai status fisiologi sel-sel. Ia juga mendedahkan korelasi antara metabolit dan status patologi organisma. Untuk menyokong kajian metabolisme, genomik dan proteomik boleh digunakan kerana ia saling berkaitan seperti yang ditunjukkan dalam angka di atas.
Metabolomics vs Metabonomics | |
Metabolomik adalah kajian set lengkap metabolit organisma | Metabonomi adalah kajian kuantitatif respon metabolik multiparametrik sistem hidup dalam masa temporal kepada rangsangan patofisiologi atau pengubahsuaian genetik. |
Keprihatinan Utama | |
Metabolomik lebih peduli dengan profil metabolik dan mengenal pasti metabolit individu yang ada di dalam sel. | Metabonomi lebih berkaitan dengan membandingkan metabolit atau profil metabolik populasi berhubung dengan pengubahsuaian genetik, penyakit, tekanan alam sekitar, rangsangan patologi, ubat-ubatan, dan sebagainya.. |
Maklumat | |
Metabolomik terutamanya tertumpu pada metabolisme endogen. | Metabonomi tidak terhad kepada metabolisme endogen. Ia meluas untuk mencari maklumat tentang gangguan metabolisme yang disebabkan oleh faktor dalaman dan luaran seperti corak pemakanan, toksin, proses penyakit, dan sebagainya.. |
Alat analitik | |
Ia menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis utama | Metabonomi menggunakan spektroskopi NMR sebagai platform analisis utama. |
Metabolit mewakili set lengkap molekul kecil yang disebut metabolit yang terdapat dalam sel atau dalam organisma. Metabolomik adalah kajian keseluruhan metabolit untuk menghasilkan profil metabolik. Metabolomik membolehkan saintis mengukur status fisiologi sebenar sel atau organisma. Metabonomi adalah sebahagian daripada metabolomik yang meluas untuk mengekstrak maklumat mengenai tindak balas metabolik pelbagai sistem hidup kepada rangsangan patofisiologi dan pengubahsuaian genetik. Metabonomi bukan hanya berkaitan dengan profil metabolik individu seperti metabolomik; ia membandingkan profil metabolik berhubung dengan faktor lain seperti tekanan alam sekitar, penyakit, toksin, dan lain-lain. Kedua-dua metabolomik dan metabolisme melibatkan kajian metabolit organisma untuk mengukur status fisiologi sebenar sel-sel. Oleh itu, kadang-kadang kedua-duanya dianggap sebagai sinonim, tanpa mempertimbangkan perbezaan antara metabolomik dan metabonomi.
Rujukan:
1. Roessner, Ute, dan Jairus Bowne. "Apa itu metabolomik." BioTechniques - Apa itu metabolomik? N.p., Apr. 2009. Web. 24 Apr. 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomik dan Metabonomi." Springer. Springer London, 01 Jan 1970. Web. 25 Apr. 2017
Image Courtesy:
1. "Skema Metabolomik" Oleh Lmaps (bercakap) - Kerja Sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons