Perbezaan Antara Penggabungan Mikro dan Susunan Generasi Seterusnya

Perbezaan Utama - Microarray vs Sequencing Generasi Seterusnya
 

Proses penjujukan DNA digunakan secara meluas dalam bidang bioteknologi, virologi, diagnosis perubatan dan sains forensik. Ini adalah satu proses yang menentukan susunan nukleotida, adenin, guanin, timin dan sitosin yang tepat dalam molekul DNA. Prosedur penjujukan DNA telah menjadi percepatan untuk penemuan ajaib dalam penyelidikan perubatan dan biologi. Kaedah penjujukan ini telah berkembang untuk menyusun genom lengkap organisma individu termasuk manusia dan spesies hidup lain. Microarrays dan Next Generation Sequencing adalah prosedur penjujukan DNA moden. Teknik microarray secara khusus berdasarkan hibridisasi yang mengandungi satu set sasaran yang diketahui. Penjujukan generasi seterusnya adalah berdasarkan sintesis (yang menggunakan polimerase DNA untuk memasukkan nukleotida) dan mempunyai keupayaan untuk menyusun genom keseluruhan bebas daripada sasaran yang dipilih sebelumnya. Ini adalah perbezaan utama antara Microarray dan Next Generation Sequencing.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Microarray 
3. Apakah urutan urutan generasi seterusnya
4. Kesamaan Antara Mikroherr dan Penjelmaan Generasi Seterusnya
5. Side by Side Perbandingan - Microarray vs Sequencing Generasi Berikutnya dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Microarray?

Microarray DNA digunakan sebagai alat makmal untuk mengenal pasti ribuan ekspresi gen yang berlainan pada masa yang sama. Ia adalah permukaan pepejal, iaitu, slaid mikroskop, yang mengandungi koleksi DNA DNA mikroskopik yang dicetak di atasnya. Setiap tempat dicetak mengandungi urutan gen yang diketahui atau gen. Ini probe yang dicetak pada slaid berfungsi sebagai probe untuk mengesan ekspresi gen. Ini dikenali sebagai transkrip. Hibridisasi antara dua helai DNA adalah asas utama microarrays berdasarkan. Ia adalah pasangan asas pelengkap urutan nukleik dengan pembentukan ikatan hidrogen.

Rajah 01: Microarray

Pada mulanya, molekul mRNA dikumpulkan dari sampel percubaan dan sampel rujukan yang diperoleh daripada individu yang sihat. Sampel eksperimen diperoleh daripada individu yang sakit; Sebagai contoh, individu yang menderita kanser. Setelah diperoleh, kedua-dua sampel mRNA ditukar kepada cDNA (DNA pelengkap). Seterusnya, setiap sampel dilabel menggunakan probe pendarfluor. Probe pendarfluor adalah warna yang berbeza untuk membezakan sampel cDNA dari cDNA rujukan. Untuk memulakan pengikatan molekul cDNA ke slaid mikroarray, kedua-dua sampel bercampur-campur. Hibridisasi adalah proses yang mana molekul cDNA dapat melekat pada probe DNA pada slaid mikroarray. Apabila hibridisasi selesai, satu siri tindak balas berlaku untuk mengenal pasti dan mengukur ungkapan setiap gen dengan rupa warna yang berbeza mengikut jumlah gen yang dinyatakan. Keputusan dari microarray digunakan dalam penciptaan profil ekspresi gen yang dapat digunakan untuk mengenal pasti keadaan penyakit yang berbeza.

Apakah urutan urutan generasi seterusnya?

Urutan Generasi Seterusnya (NGS) adalah kaedah canggih penjujukan genetik. Prinsipnya adalah sama dengan Sequencing Sanger, yang bergantung kepada elektroforesis kapilari. Dalam NGS, helai genomik dipecah dan disambungkan kepada helai template. Asas setiap helai dikenal pasti oleh isyarat yang dikeluarkan semasa proses ligasi. Dalam kaedah penjujukan Sanger, tiga langkah berasingan, penjujukan, pemisahan dan pengesanan yang terlibat. Oleh kerana langkah-langkah yang berasingan ini, automasi penyediaan sampel adalah terhad dalam throughput. Dalam NGS, teknik ini dibangunkan menggunakan urutan seragam berasaskan dengan kombinasi langkah-langkah prosedur penjujukan Sanger yang boleh menyebabkan jutaan siri tindak balas dijalankan selari pada masa yang sama; ini menghasilkan kelajuan tinggi dan throughput dengan kos yang rendah.

Rajah 02: Perkembangan dalam NGS

NGS terdiri daripada tiga langkah; penyediaan perpustakaan (penciptaan perpustakaan dengan penggunaan pemisahan rawak DNA), penguatan (penguatan perpustakaan menggunakan amplifikasi clonal dan PCR) dan penjujukan. Proses penjujukan genom yang dijalankan untuk tempoh yang sangat panjang dengan menggunakan prosedur penjujukan Sanger boleh diselesaikan dalam masa beberapa jam menggunakan NGS.

Apakah Kesamaan Antara Mikroherr dan Penggantian Generasi Seterusnya?

• Kedua-dua Microarray dan Next Generation Sequencing dibangunkan menggunakan penjujukan berasaskan array.

Apakah Perbezaan Antara Mikroherr dan Penjelmaan Generasi Seterusnya?

Microarray vs Sequencing Generasi Seterusnya
Microarray adalah kumpulan DNA mikroskopik yang dilampirkan pada permukaan pepejal, yang digunakan untuk mengukur tahap ekspresi sejumlah besar gen pada masa yang sama.	NGS (penjujukan generasi akan datang) adalah teknologi penjujukan DNA tinggi yang berasaskan bukan Sanger yang memudahkan berjuta-juta atau bilion helai DNA diurai secara selari.
Interaksi dengan Antigen
Microarray adalah berdasarkan kepada hibridisasi yang terdiri daripada satu set sasaran yang diketahui.	NGS didasarkan pada sintesis yang menggunakan polimerase DNA untuk menggabungkan nukleotida dan bebas dari sasaran yang dipilih sebelumnya.

Ringkasan - Microarray vs Sequencing Generation Next

Dalam konteks penyelidikan, penjujukan DNA telah menjadi percepatan penting. Ia digunakan secara meluas dalam bioteknologi, diagnosis perubatan, dan kajian forensik. Ia telah berkembang dan berkembang menjadi prosedur penjujukan yang lebih cekap dan cepat. Microarrays dan NGS adalah dua teknik penjujukan DNA canggih yang hadir. Kedua-duanya dibangunkan menggunakan penjujukan berasaskan pelbagai. Teknik microarray bergantung kepada hibridisasi sementara NGS didasarkan pada sintesis, yang menggunakan polimerase DNA untuk memasukkan nukleotida. Ini adalah perbezaan utama antara Microarray dan Next Generation Sequencing.

Muat turun Versi PDF daripada Microarray vs Sequencing Generasi Seterusnya

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti nota kutipan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara Penggantian Mikroherr dan Seterusnya Generasi

Rujukan:

1.Behjati, Sam, dan Patrick S Tarpey. "Apakah penjujukan generasi akan datang?" Arkib Penyakit pada Kanak-kanak. Edisi Pendidikan dan Praktik, BMJ Publishing Group, Dis. 2013, Boleh didapati di sini. Diakses pada 23 Ogos 2017
2.Bumgarner, Roger. "Tinjauan microarrays DNA." Protokol Semasa dalam Biologi Molekul, John Wiley and Sons Inc., 9 Feb. 2016, Available here. Diakses pada 23 Ogos 2017.
3. "Teknologi Microarray DNA." Institut Penyelidikan Genom Manusia Kebangsaan (NHGRI), terdapat di sini. Diakses pada 23 Ogos 2017.

Image Courtesy:

1. "DNA microarray" Oleh Guillaume Paumier (pengguna: guillom) - Kerja sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons
2. "Perkembangan dalam penjujukan generasi seterusnya" Oleh Nederbragt, Lex (2012) - (CC BY 3.0) melalui Wikimedia Commons