Probe molekul adalah sejenis fragmen DNA atau RNA yang kecil yang mengakui urutan pelengkap dalam DNA atau RNA dan membolehkan pengenalan jujukan sasaran. Primer adalah regangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik permulaan untuk sintesis DNA. Primer dan probe hibridisasi dengan nukleotida pelengkap DNA templat atau DNA sasaran. Walau bagaimanapun, perbezaan utama antara siasatan dan primer adalah bahawa Primer diperlukan untuk replikasi DNA sementara probe diperlukan untuk mengesan urutan tertentu dalam DNA sampel.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Probe
3. Apa itu Primer
4. Side by Side Comparison - Probe vs Primer
5. Ringkasan
Probe adalah serpihan kecil DNA atau RNA yang digunakan untuk mengesan DNA sasaran atau RNA dalam sampel dengan hibridisasi molekul. Mereka juga dikenali sebagai penanda molekul. Panjang siasatan boleh berbeza-beza (100 hingga 1000 pangkalan), dan nukleotida probe adalah pelengkap ke bahagian urutan sasaran. Untuk kemudahan pengesanan, probe dilabelkan dengan isotop radioaktif atau dengan pewarna pendarfluor atau antibodi. Probes mengikat dengan asas pelengkap urutan urutan dan mendedahkan kehadiran DNA sasaran atau RNA dalam sampel. Terdapat dua kaedah penyelidikan utama: pelabelan akhir dan terjemahan nick. Probes dikategorikan kepada pelbagai jenis termasuk probe DNA, probe RNA, probe cDNa dan probe oligonucleotides sintetik, dan mereka disediakan menggunakan teknik yang berbeza.
Probes adalah alat penting di banyak kawasan mikrob dan molekul seperti virologi, patologi forensik, ujian paternity, fingerprinting DNA, pengesanan penyakit genetik, RFLP, sitogenetik molekul, in situ hibridisasi, dan lain-lain.
Rajah 01: Siasatan berlabel fluorescen yang digunakan dalam IKAN untuk pengesanan patogen
Primer adalah sejenis fragmen DNA pendek atau RNA yang berfungsi sebagai pemula untuk sintesis DNA. Enzim polimerase DNA menambah nukleotida kepada sekumpulan 3 'OH urutan urutan primer dan mensintesis strand baru yang melengkapi kepada DNA templat. Primer adalah serpihan yang sangat pendek dengan panjang 18 hingga 20 nukleotida. Mereka disintesis secara kimia di makmal untuk dalam vitro Penguatan DNA (PCR). Primer boleh mempunyai sebarang urutan nukleotida kerana ia direka oleh pengguna. Mereka disintesis untuk dipadankan dengan asas pelengkap DNA templat. Oleh itu, ia boleh mempunyai urutan nukleotida. Primer adalah sangat penting untuk replikasi DNA kerana polimerase DNA tidak dapat mensintesis DNA baru tanpa sekeping DNA yang sudah ada sebelumnya. Apabila mereka bentuk primers untuk PCR, perkara berikut perlu dipertimbangkan:
Dua primer digunakan dalam PCR sebagai ke hadapan dan terbalik untuk meniru kedua-dua helai DNA sampel. Primer biasanya digunakan untuk melakukan pengurutan PCR dan DNA.
Rajah 02: Primer annealing dalam PCR
Probe vs Primer | |
Probe adalah serpihan kecil DNA / RNA yang digunakan untuk mengesan kehadiran urutan sasaran dalam sampel oleh hibridisasi molekul. | Primer adalah regangan kecil DNA atau RNA yang berfungsi sebagai titik permulaan untuk replikasi DNA. |
Fungsi | |
Ini mengesan kehadiran urutan tertentu dalam sampel DNA atau RNA. | Ini bertindak sebagai titik permulaan untuk sintesis DNA. |
Panjang | |
Panjang boleh berada dalam lingkungan 100 - 1000 pangkalan | Panjang biasanya kira-kira 18 - 20 pangkalan |
Mengikat dengan Urutan Pelengkap | |
Probe hibridisasi dengan asas pelengkap urutan sasaran | Primer anneals dengan asas pelengkap daripada helai DNA. |
Melabelkan | |
Probes dilabel untuk memudahkan pengesanan | Primer pada umumnya tidak dilabelkan |
Gunakan dalam PCR | |
Probes tidak digunakan dalam PCR | Primer digunakan dalam PCR |
Siasatan adalah serpihan kecil urutan DNA atau RNA yang boleh hibridisasi dengan nukleotida komplementer untuk mengesan urutan sasaran dalam sampel. Probes dilabel secara radioaktif, secara immunologi atau fluorescence untuk melihat kehadiran urutan sasaran. Primer adalah serpihan DNA atau RNA yang sangat kecil yang bertindak sebagai titik permulaan dalam vitro Penguatan DNA. Polimerase DNA mengenal pasti 3 'primer kumpulan OH dan memulakan pembinaan pelengkap helai baru kepada template. Probes dan primers bekerja sama dengan menggembleng dengan nukleotida pelengkap. Oleh itu, perbezaan utama antara siasatan dan primer adalah fungsi utama mereka.
Rujukan:
1. "Primer (biologi molekul)." Wikipedia. Yayasan Wikimedia, 02 Feb. 2017. Web. 01 Mac 2017.
2. "Penyiasatan hibridisasi." Wikipedia. Yayasan Wikimedia, 30 Disember 2016. Web. 01 Mac 2017
3. "Primer (biologi molekul)." Primer (biologi molekul) - Topik SainsDirect. N.p., n.d. Web. 01 Mac 2017
Image Courtesy:
1. "IKAN untuk Identifikasi Patogen Bacterial" Oleh Pepetps Togopic Ivan Akira Magnus ManskeTimothy W. Ford - (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons
2. "Primers RevComp Melted2" Oleh Richard Wheeler (Zephyris) - Kerja sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons