Perbezaan antara Proteomics dan Metabolomics

The perbezaan utama antara proteomik dan metabolomik itu proteomik adalah kajian terhadap semua protein organisma manakala metabolomik adalah kajian terhadap semua metabolit organisma.

Genomik adalah kajian tentang genetik yang dibuat oleh organisma. Proteomics dan metabolomics adalah dua ilmu sains yang berkaitan dengan genomik. Proteom merujuk kepada semua protein dalam sel atau organisma. Metabolit, sebaliknya, merujuk kepada semua metabolit organisma. Oleh itu, kajian proteom adalah proteomik sementara kajian metabolit adalah metabolomik. Kedua-dua proteomik dan metabolomik adalah penting dalam diagnostik penyakit dan dalam pencirian dan penyaringan organisma. Selain itu, kedua-duanya disambungkan dalam banyak aspek biologi sel, terutamanya dalam isyarat sel, degradasi protein dan penjanaan generasi dan selepas translasi.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Proteomics
3. Apakah Metabolomik
4. Kesamaan Antara Proteomics dan Metabolomics
5. Side by Side Comparison - Proteomics vs Metabolomics dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Proteomics?

Proteom adalah jumlah pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Oleh itu, proteomik adalah kajian terhadap protein organisme. Dalam proteomik, ciri-ciri protein yang berbeza dianalisis. Oleh itu, proteomik terutamanya memberi tumpuan kepada struktur, orientasi, fungsi, interaksi protein, pengubahsuaian, aplikasi dan kepentingan protein. Oleh itu, banyak projek penyelidikan dijalankan dalam bidang proteomik pada masa ini.

Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein keseluruhan dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Selepas kejayaan projek ini, saintis berpindah ke mencirikan kandungan protein keseluruhan dalam haiwan seperti babi guinea dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik sebagai protein adalah molekul yang mengawal kebanyakan aktiviti kerana sifat pemangkin protein. Oleh itu, kajian keseluruhan protein dapat memberi maklumat mengenai status kesihatan organisma. Selain itu, proteomik mempunyai banyak aplikasi dalam penjelasan genom, pengenalan penyakit dan diagnostik, menjalankan kajian ekspresi protein semasa percubaan dan pengubahsuaian protein dan kajian interaksi, dan sebagainya..

Rajah 01: Proteomics

Terdapat pelbagai teknik yang terlibat dalam proteomik, termasuk pengekstrakan jumlah protein, pemisahannya menggunakan elektroforesis gel 2D, penjujukan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau spektrometri massa dan analisis ciri-ciri struktur dan fungsi protein yang digunakan perisian berasaskan komputer dan alatan bioinformatik.

Apa itu Metabolomik?

Metabolomik adalah kajian terhadap semua metabolit dalam sel, tisu atau organisma. Ini termasuk pengenalpastian dan kuantifikasi metabolit selular menggunakan alat analitik dan statistik maju yang berbeza. Metabolomik adalah kajian penting kerana ia mendedahkan maklumat mengenai metabolisme organisma.

Rajah 02: Metabolomik

Untuk mengkaji substrat dan produk reaksi metabolik, metabolomik menggunakan spektrometri massa sebagai platform analisis. Spektrometri massa menghasilkan metabolit dan kepekatan mereka, mencerminkan keadaan biokimia sebenar sel atau tisu. Oleh itu, metabolomik boleh dianggap sebagai perwakilan terbaik fenotip molekul organisme. Di samping itu, metabolomik boleh dipertimbangkan sebagai lanjutan proteomik kerana kebanyakan metabolit dihasilkan disebabkan aktiviti enzim yang merupakan protein.

Apakah Kesamaan Antara Proteomik dan Metabolomik?

• Proteomics dan metabolomics adalah dua ilmu sains yang berkaitan dengan genomik.
• Metabolomik boleh dianggap sebagai pelanjutan proteomik.
• Proteometri dan metaboloma sangat saling berkaitan dengan banyak kajian.

Apakah Perbezaan Antara Proteomik dan Metabolomik?

Proteomics adalah kajian besar-besaran protein termasuk struktur dan fungsi mereka, dalam sel atau organisma. Sementara itu, metabolomik adalah kajian profil metabolit dalam sel, tisu atau organisma di bawah satu set syarat yang diberikan. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara proteomik dan metabolomik. Selain itu, proteomik terutamanya merangkumi set lengkap protein manakala metabolomik terutamanya berkaitan dengan set lengkap metabolit, termasuk pelbagai molekul kecil seperti peptida, karbohidrat, lipid, nukleosida, dan produk katabolik daripada sebatian-sebutan eksogen, dan lain-lain. perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Infographic di bawah merangkumi perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Ringkasan - Proteomics vs Metabolomics

Organisme hidup boleh dikaji menggunakan genom, protein dan metabolit mereka. Genomik, proteomik dan metabolom adalah tiga bidang yang mengkaji genetik, protein dan metabolit sel atau organisma masing-masing. Proteomics adalah penting kerana ia merupakan refleksi dinamik kedua-dua gen dan alam sekitar. Metabolomik sangat penting kerana ia secara langsung mencerminkan status semasa reaksi biokimia sel atau status metabolik organisma. Oleh itu, ini merangkumi perbezaan antara proteomik dan metabolomik.

Rujukan:

1. P, Surat. "Bagaimana Metabolit dan Proteo Berkaitan?" Berita, 26 Feb. 2019, Boleh didapati di sini.
2. Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. "Kajian SAC 'Omic' Technologies: Genomics, Transcriptomics, Proteomics and Metabolomics." Obstetrik dan Ginekologi, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 Julai 2011, terdapat di sini.

Image Courtesy:

1. "Proteomics" Oleh Xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggeris - Dipindah dari en.wikibooks ke Commons. (Domain Awam) melalui Wikimedia Commons
2. "Skema Metabolomik" Oleh Lmaps (bercakap) - Saya telah mencipta karya ini sepenuhnya oleh saya sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons