Differkinome

Perbezaan antara Proteomics dan Transcriptomics

Sains & Alam
Share

Perbezaan Utama - Proteomics vs Transkriptik
  

Teknologi omic adalah trend semasa, di mana biomolekul yang berlainan daripada organisma dilihat sebagai koleksi keseluruhan berkenaan sifat dan fungsinya. Teknologi omic mempunyai pelbagai aplikasi. Oksigen yang berbeza daripada sampel biologi termasuk genomik, proteomik, transkriptik dan metabolomik. Proteomics melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. Ia ditakrifkan sebagai satu set semua protein yang dinyatakan dalam organisma, sifat-sifat struktur dan fungsinya. Oleh itu, set protein yang lengkap membentuk protein. Transkrip adalah kajian yang lengkap terhadap semua molekul RNA (mRNA) yang hadir dalam organisma hidup. Oleh itu, transkriptik berkaitan dengan gen yang secara aktif dinyatakan dalam organisma hidup. Set keseluruhan mRNA dalam organisma hidup disebut sebagai transkrip. The perbezaan utama antara Proteomics dan Transcriptomics adalah berdasarkan kepada jenis biomolekul. Dalam proteomik, jumlah protein yang dinyatakan dalam organisma hidup dikaji sedangkan, dalam transkriptik, jumlah mRNA organisma hidup dikaji.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Proteomics
3. Apakah Transkrip
4. Kesamaan Antara Proteomics dan Transcriptomics
5. Side by Side Comparison - Proteomics vs Transcriptomics dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apa itu Proteomics?

Istilah proteomik dicipta pada tahun 1995 dan pada awalnya ditakrifkan sebagai jumlah pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Dengan kemajuan dalam kajian proteomik, ia kemudian diubah suai untuk dipertimbangkan sebagai istilah payung di mana banyak bidang kajian dimasukkan. Pada masa ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksinya, pengubahsuaiannya, aplikasinya dan kepentingan protein dipelajari. Oleh itu, banyak penyelidikan dijalankan dalam bidang proteomik pada masa ini.

Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan kandungan protein keseluruhan dilakukan menggunakan gel dua dimensi (2D). Apabila kejayaan ini, saintis berpindah ke mencirikan kandungan protein dalam haiwan seperti guinea babi dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan menggunakan elektroforesis gel 2D.

Aplikasi Proteomics

Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik, kerana protein adalah molekul yang mengawal kebanyakan aktiviti kerana sifat pemangkin protein. Oleh itu, kajian keseluruhan protein dapat memberi maklumat mengenai status kesihatan organisma. Sesetengah aplikasi adalah;

  1. Penjelasan genom: Dengan mengkaji kandungan protein organisma, genom yang tepat yang bertanggungjawab untuk sebatian protein aktif dapat ditentukan. Dalam senario ini, hasil dari semua genom, Transkriptik dan proteomik adalah penting.
  2. Pengenalpastian penyakit / Diagnostik: Proteomik digunakan dalam mengenalpasti keadaan penyakit, dengan membandingkan orang yang sihat dan berpenyakit
  3. Untuk dilaksanakan ungkapan protein belajar semasa percubaan.
  4. Pengubahsuaian protein dan kajian interaksi: Untuk menggunakan protein dalam vitro keadaan atau dan dalam vivo keadaan, untuk menentukan keadaan penyimpanan protein yang diekstrak dan untuk mengkaji kelakuan protein dalam dalam vitro, dalam vivo dan kaedah silico.

Rajah 01: Proteomics

Terdapat pelbagai teknik yang terlibat dalam proteomik

  1. Pengekstrakan jumlah protein dan memisahkan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga boleh dipisahkan menggunakan Chromatography Cecair Berprestasi Tinggi (HPLC).
  2. Urutan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau Mass spectrometry.
  3. Setelah urutan dikenal pasti, sifat-sifat struktur dan fungsi kandungan protein dianalisis menggunakan perisian berasaskan komputer dan alat bioinformatik.

Apakah Transkrip?

Istilah transkrip dicipta baru-baru ini. Transkrip adalah kajian terhadap kandungan mRNA total organisme. Jumlah mRNA adalah DNA yang dinyatakan dalam organisma hidup atau sel. Pengumpulan lengkap mRNA dirujuk sebagai transkrip.

Langkah-langkah ke arah menganalisis transkrip ini termasuk,

  1. Pengekstrakan RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi gel lajur dengan manik-manik DT poli.
  2. Penjujukan mRNA dilakukan.

Teknologi microarray adalah satu cara yang biasa untuk mengenal pasti transkrip organisme. Teknik microarray melibatkan plat penyiasat dengan helai pelengkap transkrip. Apabila hibridisasi, mRNA yang hadir dalam organisma atau sel boleh dicirikan.

Rajah 02: Teknik Transkrip

Transkriptik kini banyak digunakan di bidang perubatan. Diagnosis penyakit dan profil penyakit adalah bidang utama di mana Transcriptomics digunakan. Dengan menganalisis transkrip organisme, mRNA asing boleh dikenal pasti, dan jika terdapat sebarang jangkitan, ia dapat dikenalpasti. RNA bukan pengekodan boleh dipisahkan dengan menggunakan teknologi transkrip. Dan juga ekspresi gen di bawah tekanan alam sekitar yang berbeza boleh dipantau.

 Apakah Kesamaan Antara Proteomik dan Transkriptik?

  • Kedua-duanya membentuk sebahagian daripada konsep teknologi omic.
  • Kedua-duanya digunakan dalam diagnosis penyakit dan pencirian penyakit organisma.
  • Kedua-dua kawasan kajian melibatkan pengekstrakan biomolekul, pemisahan langkah-langkah biomolekul dan penjujukan.

Apakah Perbezaan antara Proteomics dan Transcriptomics?

Protemik vs Transkrip
Proteomics melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. Transkrip adalah kajian yang lengkap terhadap semua molekul RNA (mRNA) yang hadir dalam organisma hidup.
Jenis Bio Molecule Studied 
Protein dipelajari dalam proteomik. mRNA dipelajari dalam transkrip.
Faktor-faktor yang dikaji
Struktur, fungsi, interaksi, pengubahsuaian dan penggunaan protein dipelajari dalam proteomik. Struktur urutan, interaksi dengan persekitaran dan aplikasi mRNA dipelajari dalam transkrip.

Ringkasan - Proteomics vs Transkriptik 

Omics memainkan peranan penting dalam bidang sains hayat. Proteomics merujuk kepada kajian proteome yang membentuk koleksi lengkap protein dalam sel atau organisma. Transkriptik merujuk kepada kajian transkrip yang merupakan set lengkap DNA yang dinyatakan dalam bentuk mRNA. Kedua-dua bidang kajian, proteomik dan transkriptik, diperolehi selepas pengenalan genomik dan kini digunakan secara meluas dalam diagnostik perubatan dan dalam pencirian dan penyaringan organisma. Ini adalah perbezaan antara proteomik dan transkrip.

Muat turun PDF Proteomics vs Transcriptomics

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar seperti peringatan kutipan. Sila muat turun versi PDF di sini: Perbezaan antara Proteomics dan Transcriptomics

Rujukan:

1.Horgan, Richard P, dan Louise C Kenny. "Teknologi 'Omic': genomik, transkriptik, proteomik dan metabolomik." Pakar Obstetrik & Ginekologi, Blackwell Publishing Inc, 18 Julai 2011. Boleh didapati di sini  
2.Graves, Paul R., dan Timothy A. J. Haystead. "Panduan Biologi Molekul untuk Proteomics." Ulasan Mikrobiologi dan Molekul, Persatuan Mikrobiologi Amerika, Mac 2002. Boleh didapati di sini
3.Lowe, Rohan, et al. "Teknologi transkriptologi." PLoS Biology Computational, Perpustakaan Awam Sains, Mei 2017. Boleh didapati di sini  

Image Courtesy:

1.'Proteomics'By Xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggeris - Dipindah dari en.wikibooks ke Commons., (Public Domain) melalui Wikimedia Commons
2.'Microarray dan penjejakan aliran sel 'oleh Thomas Shafee - Kerja sendiri, (CC BY 4.0) melalui Wikimedia Commons

Sains & Alam
×