Perbezaan Antara shRNA dan siRNA

shRNA vs siRNA

Semasa proses gangguan RNA (RNAi), ungkapan gen sasaran ditebang dengan kekhususan tinggi dan selektiviti. RNAi adalah proses semulajadi, dan ia melibatkan RNA mengganggu kecil (siRNA) dan RNA rambut pendek pendek (shRNA) dan shRNA bi-fungsi. Pada masa ini, RNAi digunakan secara meluas sebagai alat untuk terapi kanser yang diperibadikan. Aplikasi RNAi pada dasarnya dilakukan dengan molekul shRNA yang berasaskan sintetik kimia dan sintetik shRNA. Walaupun kedua-dua molekul ini mempunyai hasil yang serupa, mereka berbeza dalam strukturnya; oleh itu, mekanisme tindakan molekul, jalur RNA, dan kesan luar sasaran kedua-dua molekul ini juga berbeza.

shRNA

shRNA adalah urutan molekul RNA kecil yang membuat giliran rambut yang ketat yang boleh digunakan untuk membungkam ekspresi gen sasaran semasa RNAi. Ungkapan shRNA dicapai oleh vektor, yang boleh berupa virus atau bakteria atau dengan pemberian plasmid. Mereka disintesis dalam nukleus sel dan diangkut ke sitoplasma untuk proses selanjutnya. Molekul-molekul ini mempunyai laluan pematangan yang sama miRNA; oleh itu sintesis miRNA telah menyediakan asas untuk memahami sintesis shRNA. Sama ada RNA polimerase II atau III boleh menyalin shRNA melalui RNA polymerase II atau III promotor. Kelebihan penggunaan shRNA adalah bahawa mereka mempunyai kadar degradasi dan perolehan yang agak rendah. Kelemahannya ialah ia memerlukan vektor ekspresi, yang boleh menyebabkan beberapa isu keselamatan.

siRNA

siRNA adalah dua molekul RNA terkandas yang terdiri daripada 20 hingga 25 pasangan asas panjang. Ini digunakan untuk penindasan gen dengan membubarkan mana-mana gen dengan urutan nukleotida pelengkap dalam laluan RNAi. Pengetatan gen oleh transfection siRNA sering kali tidak berjaya kerana kesan sementara; terutamanya dalam sel yang membahagikan dan penindasan tidak lagi bertahan lama. Untuk mengatasi masalah ini, siRNA diubahsuai dengan memperkenalkan struktur rambut pendek pendek. Ini molekul diubah suai kemudian dikenali sebagai shRNA. shRNA perlu ditukar kepada siRNA oleh Dicer untuk meneruskan fungsi normalnya.

Apakah perbezaan antara shRNA dan siRNA?

• Tidak seperti siRNA, shRNA mempunyai struktur rambut tambahan. shRNA adalah versi yang diubahsuai dari siRNA.

• shRNA memerlukan vektor ekspresi, sedangkan siRNA tidak.

• shRNA boleh digunakan untuk knockdown jangka panjang sementara siRNA boleh digunakan hanya untuk knockdown jangka pendek gen.

• Tidak seperti penindasan gen siRNA, penindasan shRNA adalah tahan lama, dan jika ia dimasukkan melalui vektor virus yang sesuai, ia boleh menghasilkan kesan pembiakan gen kekal.

• Dicer diperlukan untuk menukar shRNA kembali ke molekul siRNA untuk melaksanakan fungsi normalnya.