Istilah gel gel dan pemisahan gel digunakan untuk menerangkan teknik SDS-PAGE. SDS-PAGE atau elektroforesis gel natrium dodekil sulfat-polyacrylamide adalah teknik makmal yang digunakan untuk memisahkan molekul protein berdasarkan berat molekul mereka. Teori di sebalik teknik itu ialah protein yang mempunyai berat molekul yang berbeza menunjukkan kadar penghijrahan yang berbeza; molekul berat molekul rendah berpindah lebih cepat manakala molekul berat molekul tinggi berhijrah secara perlahan. Medium untuk penghijrahan adalah gel. Terdapat dua jenis gel yang dinamakan sebagai gel penyusun dan memisahkan gel. The perbezaan utama antara gel penempel dan pemisahan gel ialah pH gel penyusun adalah 6.8 sedangkan pH gel pemisahan adalah 8.8.
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Gel Stacking
3. Apakah Gel Pemisah
4. Hubungan Antara Gel Stacking dan Gel Pemisah
5. Side by Side Comparison - Gel Gel Gel Pemisahan Gel dalam Borang Tabular
6. Ringkasan
Gel menyusun adalah gel polyacrylamide pekat yang rendah yang diletakkan di bahagian atas gel pemecah yang lebih pekat (pemisahan gel) dalam teknik SDS-PAGE. Gel penyusun digunakan untuk memperbaiki resolusi elektroforesis. Resolusi ini meningkat kerana perbezaan antara kepekatan gel penyusun dan gel pemecahan yang memberi kesan kepada protein dalam sampel. Oleh kerana kepekatan polyacrylamide dalam gel penyusun adalah rendah, saiz liang lebih tinggi. Ini juga membantu dalam meningkatkan pemisahan.
Gel penyusun adalah gel polyacrylamide longgar dengan liang besar kira-kira 7% polyacrylamide. Pori-pori ini tidak berfungsi sebagai halangan besar untuk molekul protein besar. Oleh itu, gel ini memberi sedikit kesan terhadap pergerakan protein tersebut. Ini menjadikan pemisahan mengikut mobiliti dan saiz protein dengan menumpukan mereka di antara dua gel.
Rajah 01: SDS-PAGE Acrylamide Gel
PH gel penyusun adalah 6.8. PHnya adalah berasid daripada gel penyelesaian oleh 2 unit pH. PH ini membayangkan kekuatan ionik yang lebih rendah dengan itu rintangan elektrik yang lebih tinggi. Ini menimbulkan pergerakan protein daripada zarah-zarah lain yang ada di gel.
Pemisahan gel atau gel pemecah SDS-PAGEtechnique adalah gel polyacrylamide yang sangat tertumpu yang diletakkan di bahagian atas gel penumpukan yang rendah. Gel pemisah mengandungi sejumlah besar polyacrylamide (10%). PH gel ini dikekalkan sebagai pH = 8.8, iaitu tahap pH yang lebih tinggi daripada gel stacking.
Rajah 02: Alat Gel Elektroforesis Gel
Apabila molekul protein mencapai gel pemisahan, penghijrahan molekul tersebut perlahan kerana gel pemisah adalah gel kepekatan yang tinggi dengan saiz liang kecil yang boleh bertindak sebagai halangan yang besar untuk pergerakan molekul protein. Kelembapan ini membolehkan protein-protein lain bergerak perlahan-lahan untuk mengejar, mengakibatkan band sempit, tertumpu di antara kedua-dua gel.
Menyusun Gel vs Gel Pemisahan | |
Gel menyusun adalah gel polyacrylamide pekat yang rendah yang diletakkan di bahagian atas gel pemecah yang lebih pekat (pemisahan gel) dalam teknik SDS-PAGE. | Pemisahan gel atau gel pemecutan teknik SDS-PAGE adalah gel polyacrylamide yang sangat tertumpu yang diletakkan di bahagian atas gel penumpukan yang rendah. |
Penempatan | |
Melekat gel diletakkan pada gel pemecah (memisahkan). | Gel pemisahan diletakkan di bahagian bawah bekas yang digunakan untuk elektroforesis gel. |
Kepekatan | |
Kepekatan gel penyusun adalah tinggi. | Kepekatan pemisahan gel adalah rendah. |
Kandungan Polyacrylamide | |
Gel menyusun mengandungi kira-kira 7% polyacrylamide. | Pemisahan gel mengandungi kira-kira 10% polyacrylamide. |
pH | |
PH gel penyusun adalah 6.8. | PH gel pemisah ialah 8.8. |
Saiz Lubang | |
Saiz liang besar terdapat dalam gel penumpuk. | Saiz liang kecil hadir dalam memisahkan gel. |
Resolusi | |
Melekatkan gel memberikan resolusi yang lebih baik. | Gel pemisahan memberikan resolusi yang lemah. |
Gel menyusun dan memisahkan gel adalah dua jenis gel polyacrylamide yang digunakan untuk mendapatkan pemisahan molekul protein yang lebih baik dalam sampel yang diberikan. Perbezaan antara gel menyusun dan memisahkan gel adalah bahawa pH gel penyusun adalah 6.8 sedangkan pH gel pemisahan adalah 8.8.
1. "Elektroforesis Gel Polyacrylamide." Elektroforesis Gel Polyacrylamide (Teori): Makmal Maya Biologi Molekul II: Bioteknologi dan Kejuruteraan Bioperubatan: Amrita Vishwa Vidyapeetham Virtual Lab. Terdapat di sini
2. "Bagaimana SDS-PAGE berfungsi." Bitesize Bio, 16 Feb. 2018. Boleh didapati di sini
3. "SDS-PAGE menyusun gel - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)." Tapak Google. Terdapat di sini
1. 'SDS-PAGE Acrylamide gel'By Bensaccount di Wikipedia bahasa Inggeris, (CC BY 3.0) melalui Wikimedia Commons
2.'Gel elektrophoresis 'oleh Jeffrey M. Vinocur - Kerja sendiri, (CC-BY 2.5) melalui Wikimedia Commons