Perbezaan Antara Proteomik Tersasar dan Tidak Terpencar

Perbezaan utama antara proteomik sasaran dan tidak bertarget adalah bahawa proteomik yang disasarkan bertujuan untuk mengukur banyaknya protein tertentu manakala proteomik yang tidak bertarget tidak menyasarkan protein tertentu.

Proteomics adalah kajian besar-besaran protein, struktur dan fungsi mereka. Ia mengkaji keseluruhan pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma di bawah keadaan tertentu. Terdapat dua jenis proteomik sebagai proteomik yang disasarkan dan proteomik yang tidak bertarget.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Proteomik yang Sasaran
3. Apakah Proteomics Untargeted
4. Persamaan Antara Proteomik Tersasar dan Tidak Terpencar
5. Side by Side Comparison - Target vs Proteomics Untargeted dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apa yang dimaksudkan dengan Proteomics?

Seperti yang ditunjukkan namanya, proteomik yang disasarkan menargetkan protein tertentu atau peptida dalam campuran kompleks protein untuk analisis. Kemudian ia menganalisis kehadiran dan kuantiti protein spesifik yang dipilih. Kaedah ini mungkin hanya satu sampel atau merangkumi pelbagai sampel. Kaedah ini sesuai walaupun untuk kumpulan tertentu protein. Ia menghasilkan data yang lebih tepat, kuantitatif dan sensitif. Lebih-lebih lagi, spektrometri jisim ditambah dengan proteomik yang disasarkan menghasilkan pengukuran yang lebih tepat. Kaedah ini menggunakan spektrometer jisim triple quadrupole (QQQ) untuk analisisnya.

Rajah 01: Proteomics

Protein yang disasarkan adalah kaedah yang sesuai jika anda ingin mengesahkan sama ada sasaran knockdown sebenarnya ditebang atau apabila anda ingin mengkuantifikasi protein / peptida tertentu dalam serum darah, cecair serebral atau dalam lysate sel dan lain-lain. Anda juga boleh menggunakannya jika anda mahu untuk memeriksa sama ada protein tertentu secara berbeza dinyatakan dalam sampel atau semasa eksperimen kursus masa.

Apakah Proteomics Untargeted?

Proteom tak ternilai, seperti namanya, tidak mensasarkan protein atau peptida tertentu untuk analisanya. Discovery proteomics adalah nama lain untuk proteomik Untargeted. Malah, ia adalah analisis yang lebih 'global'. Umumnya, melaksanakan protein tidak bertarget adalah untuk menjawab soalan "apa protein atau protein dalam sampel ini atau sampel berganda?". Kaedah ini tidak sensitif sebagai proteomik yang disasarkan. Tetapi ia boleh mengenal pasti dan mengukur banyak protein termasuk protein novel. Proteom yang tidak terpilih dapat menghasilkan pengukuran kuantitatif dan kualitatif.

Apakah Kesamaan Antara Proteomik Tersasar dan Tidak Ditetapkan??

• Kedua-dua prototaik sasaran dan tidak sasaran mengukur protein dalam sampel.
• Ia penting dalam analisis proteome.
• Kaedah ini menggunakan spektrometri jisim.

Apakah Perbezaan Antara Proteomik Tersasar dan Untargeted?

Pertama, proteomik yang disasarkan adalah penentuan kehadiran dan kuantiti protein atau peptida tertentu dalam campuran kompleks protein. Sebaliknya, proteomik tidak bertarget adalah kajian kuantitatif dan kualitatif protein yang ada dalam sampel atau sampel tanpa mensasarkan protein tertentu. Protein yang disasarkan dilakukan dengan protein preselected atau disasarkan sementara protein tidak bertarget dilakukan untuk mengetahui jenis protein dalam sampel ini. Lebih-lebih lagi, proteomik yang disasarkan lebih sensitif daripada proteomik yang tidak disasarkan.

Ringkasan - Target Proteomics Untargeted

Sebagai kesimpulan, proteomik sasaran dan tidak bertarget adalah dua jenis kajian protein. Seperti yang dicadangkan oleh nama mereka, proteomik yang disasarkan menargetkan protein tertentu sementara protein tidak bertarget tidak menyasarkan protein tertentu. Inilah perbezaan antara proteomik sasaran dan tidak bertarget.

Rujukan:

1. "Proteomik yang Sasaran." UC Davis Proteomics Core, Available here.
2. "Proteomics / Introduction to Proteomics." Teori / Mod Muzik - Wikibooks, Buku Terbuka untuk Dunia Terbuka, Boleh didapati di sini.

Image Courtesy:

1. "Proteomics" Oleh Xxl7441 di Wikibooks Bahasa Inggeris - Dipindah dari en.wikibooks ke Commons (Public Domain) melalui Wikimedia Commons