Adalah penting untuk mempunyai pengetahuan umum mengenai komposisi dan struktur DNA untuk memahami perbezaan antara hulu dan hiliran DNA. DNA terdiri daripada rantai polynukleotide. Nukleotida adalah blok bangunan yang menghasilkan rantaian polynukleotide dan setiap nukleotida dibuat dari tiga komponen: gula lima-karbon, asas nitrogen, dan kumpulan fosfat. Kumpulan fosfat dan kumpulan OH dilampirkan pada kedudukan karbon '5 dan karbon kedudukan 3' daripada molekul gula dalam nukleotida. Nukleotida disatukan oleh ikatan fosfodiester yang terbentuk antara kumpulan fosfat 5 'satu nukleotida dan kumpulan OH 3' nukleotida bersebelahan. Sekiranya rantaian polynucleotide mempunyai kumpulan fosfat bebas 5, ia ditugaskan sebagai akhir 5 '; jika ia mempunyai kumpulan 3 'OH percuma, ia ditugaskan sebagai akhir 3'. Oleh itu, helai DNA biasanya mempunyai 5 'dan 3' hujung mengikut kedudukan akhir rantai polynukleotide. DNA juga wujud sebagai bentuk double-stranded. Dua helai adalah antiparallel antara satu sama lain. Oleh itu, DNA mempunyai dua helai yang bergerak ke arah 5 'ke 3 arah dan 3' ke 5 'arah. DNA hulu dan hiliran dirujuk dengan rujukan kepada transkripsi dan sintesis mRNA 5 'hingga 3'. Jika DNA dipertimbangkan ke arah akhir 5 pengikatan dari tapak penyambungan transkripsi ia dikenali sebagai DNA hulu. Sekiranya DNA dipertimbangkan ke arah akhir 3 'dari pengikatan kodai dari tapak permulaan transkripsi diketahui sebagai DNA hiliran. Ini adalah perbezaan utama antara hulu dan hiliran DNA.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah DNA Hulu
3. Apakah DNA Hiliran
4. Side by Side Comparison - Hulu vs DNA Hiliran
5. Ringkasan
Satu gen adalah keturunan unit struktur dan fungsi yang terletak pada DNA organisma. Ia disimpan dengan arahan untuk membina protein. Gen ini mempunyai kawasan khusus molekul DNA. Apabila diperlukan, ia menyalin dan diterjemahkan ke dalam protein melalui sintesis strand mRNA. Biasanya pengekod gen gen berjalan dari arah 5 'ke 3'. Apabila ia ditranskripsikan, ia menghasilkan helai mRNA ke arah yang sama 5 'hingga 3'. Semasa transkripsi, untai antisense 3 'ke 5' dihidangkan sebagai hela tempa dan memulakan sintesis mRNA. Terdapat tapak permulaan transkripsi dalam gen. Dengan merujuk kepada laman inisiasi transkripsi, rantau DNA ke arah penghujung pengekalan '5' dikenali sebagai DNA hulu. Seorang promoter gen biasanya terletak di kawasan hulu DNA. Dalam eukaryotic gen, terdapat kotak TATA, unsur proksimal promoter, dan penambah di kawasan hulu ke gen. Ruas hulu gen dirujuk dengan nombor negatif. DNA hulu gen adalah sangat penting untuk transkripsi.
Tapak inisiasi transkripsi dikenali sebagai titik 1 gen. Rangkaian DNA dari titik 1 ke arah akhir 3 '' '' '' 'pengisaran strand dikenali sebagai DNA hiliran. Dalam erti kata lain, hiliran gen adalah dari tapak permulaan transkripsi ke arah akhir '5' dari helai templat. Oleh itu, DNA hiliran rantau gen merangkumi unit transkrip dan urutan lain seperti urutan terminator. Promoter boleh mempengaruhi urutan hiliran gen. Bahagian hiliran daripada gen disebut dengan nombor positif. DNA hiliran gen adalah rantau sebenar yang memberikan produk protein.
Rajah 01: DNA Hulu dan Hiliran
Hulu vs DNA Hiliran | |
Rantau DNA ke arah akhir '5' urutan pengekodan dari tapak permulaan transkripsi dikenali sebagai DNA hulu. | Rangkaian DNA ke arah akhir 3 '' pengikatan dari tapak inisiasi transkripsi dikenali sebagai DNA hiliran. |
Elemen | |
Promoter dan enhancer terletak pada DNA hulu | Unit transkripsi dan urutan terminator terletak pada DNA hiliran. |
Penomboran | |
Nukleotida di rantau hulu dirujuk dengan nombor negatif | Nukleotida dirujuk dengan nombor positif. |
Fungsi | |
Rantau ini mengandungi elemen yang diperlukan untuk mengawal dan memulakan transkripsi | Rantau ini mengandungi arahan untuk menghasilkan protein dan menamatkan transkripsi |
Adalah mudah untuk mengenal pasti hulu dan hiliran rantaian RNA. Berkenaan dengan tapak rujukan, rantau ini ke arah 5 'akhir strata RNA dikenali sebagai RNA hulu sedangkan rantau ke arah akhir 3' dikenali sebagai RNA hiliran. Walau bagaimanapun, dalam DNA, terdapat dua helai yang berjalan di kedua arah 5 'hingga 3' dan 3 'hingga 5'. Oleh itu, perbezaan antara hulu dan hiliran DNA adalah rumit. Oleh itu, ia dibezakan dengan merujuk kepada transkripsi gen. Dari tapak permulaan transkripsi ke arah akhir 5 ujung telinga, rantau DNA dikenali sebagai DNA hulu manakala dari tapak permulaan transkripsi ke arah akhir 3 'selak akal dikenal sebagai DNA hiliran. Ini adalah perbezaan antara hulu dan hiliran DNA.
Rujukan:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi, dan Jonatha M. Gott. "Peranan tersirat untuk urutan hulu dan hiliran dari laman Physarumediting." RNA. Press Lab Laboratory Cold Spring, Sept. 2009. Web. 18 Mac 2017
Image Courtesy:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro, dan Luísa Romão. "Peraturan Pengecualian Gene oleh Frasa Bacaan Terbuka Hulu dan Penyakit Manusia." PLOS Genetik. Perpustakaan Awam Sains, n.d. Web. 18 Mac 2017.