Perbezaan Antara VNTR dan STR

Perbezaan Utama - VNTR vs STR
 

Kajian DNA mempunyai kegunaan yang sangat besar dalam memahami dan menentukan hubungan filogenetik, mendiagnosis penyakit genetik dan genom organisma pemetaan. Beberapa teknik yang dikaitkan dengan analisis DNA digunakan untuk mengenal pasti gen tertentu atau urutan DNA dalam kumpulan DNA yang tidak diketahui. Mereka dikenali sebagai penanda genetik. Penanda genetik digunakan dalam biologi molekular untuk mengenal pasti variasi genetik antara individu dan spesies. Ulang tandem nombor berubah-ubah (VNTR) dan pengulangan tandem pendek (STR) adalah dua jenis penanda genetik yang menunjukkan polimorfisme di kalangan individu. Kedua-dua jenis ini adalah DNA berulang tanpa kod yang berulang-ulang. Mereka disusun di kepala ke fesyen ekor dalam kromosom. VNTR adalah bahagian genom di mana urutan nukleotida pendek diulang beberapa kali. STR adalah satu lagi bahagian DNA dalam genom yang diorganisasikan sebagai unit pengulangan yang terdiri daripada dua hingga tiga belas nukleotida dalam seratus kali. Perbezaan utama antara VNTR dan STR ialah bilangan nukleotida dalam urutan berulang. Unit pengulangan VNTR terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida manakala unit pengulangan STR terdiri daripada 2 hingga 13 nukleotida. VNTR dan STR digunakan secara meluas dalam kajian forensik.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah VNTR 
3. Apakah STR
4. Kesamaan Antara VNTR dan STR
5. Side by Side Comparison - VNTR vs STR dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apakah VNTR itu?

Ulangan tandem adalah urutan pendek DNA yang diulang di kepala ke ekor fesyen pada lokus kromosom tertentu. Tiada urutan lain atau nukleotida dalam ulangi tandem. Terdapat beberapa jenis tandem berulang dalam genom. VNTR adalah sejenis tandem berulang antara mereka yang mempunyai unit berulang yang terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida. VNTR adalah sejenis minisatelit. Ulangan tandem ini boleh didapati di banyak kromosom. Mereka diselingi dalam genom manusia dan terletak di wilayah subtelomerik kromosom.

 VNTRs menunjukkan polimorfisme berulang tandatangan di kalangan individu. Panjang VNTR di lokasi tertentu kromosom sangat berubah-ubah di kalangan individu disebabkan oleh variasi dalam bilangan unit yang diulangi di dalam seksyen DNA tersebut. Oleh itu, VNTR boleh digunakan sebagai alat yang berkuasa dalam mengenal pasti individu dan analisis VNTR digunakan dalam banyak bidang termasuk genetik, penyelidikan biologi, forensik dan pencetakan jari DNA. VNTRs adalah penanda genetik pertama yang digunakan untuk mengukur engraftment pemindahan sumsum tulang. VNTR juga merupakan penanda polymorphic pertama yang digunakan dalam profil DNA dalam forensik.

Rajah 01: Variasi VNTR dalam enam individu

Analisis VNTR dilakukan melalui polimorfisme panjang pecahan yang diikuti oleh hibridisasi selatan. Oleh itu, ia memerlukan sampel DNA yang besar. Tafsiran profil VNTR juga bermasalah. Oleh kerana batasan-batasan ini, penggunaan VNTR dalam genetik forensik telah terhad dan digantikan oleh analisis STR.

Apakah STR?

STR adalah sekumpulan DNA yang berulang-ulang yang terdiri daripada dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang dianjurkan secara bersamaan. STR adalah sama dengan VNTR. Tetapi ia berbeza dari VNTR dari bilangan nukleotida dalam urutan berulang dan bilangan ulangan. STR adalah sejenis mikrosatelit.

Analisis STR yang terlibat dalam mengukur bilangan unit pengulangan yang tepat. STR adalah sangat berubah-ubah di kalangan individu, sama seperti VNT. Profil STR berbeza dari orang ke orang. Oleh itu, analisis STR digunakan dalam biologi molekular untuk membandingkan loci spesifik pada DNA daripada dua atau lebih sampel. Oleh itu STRs dianggap penanda genetik yang kuat dalam biologi molekul. Ia menyediakan alat yang sangat baik untuk mengenal pasti individu kerana tahap polimorfisme mereka yang tinggi dan panjangnya agak pendek.

Pada masa ini, STRs adalah alat polimorfisme genetik dianalisis yang paling biasa digunakan dalam genetik forensik. Kebanyakan kerja-kerja forensik melibatkan analisis STR polymorphic. STR loci tersebar di seluruh genom. Terdapat ribuan STR yang terletak di kromosom yang boleh digunakan dalam analisis forensik. Analisis STR tidak melibatkan polimorfisme panjang pembatasan seperti analisis VNTR. Analisis STR tidak memotong DNA dengan enzim sekatan. Projek tertentu digunakan untuk melampirkan kawasan yang dikehendaki pada DNA dan menggunakan teknik PCR, panjang STR ditentukan.

Rajah 02: Variasi STR antara sampel

Apakah Kesamaan Antara VNTR dan STR?

  • VNTR dan STR adalah DNA tanpa kod.
  • Kedua-duanya berulang.
  • Kedua-duanya menunjukkan polimorfisme di kalangan individu kerana perbezaan dalam panjang bahagian DNA.
  • Kedua-duanya digunakan sebagai penanda genetik yang kuat dalam pencetakan jari DNA dan dalam kajian forensik.

Apakah Perbezaan Antara VNTR dan STR?

VNTR vs STR

VNTR adalah DNA berulang tanpa kod yang mempunyai urutan nukleotida pendek berulang dengan cara yang sama. STR adalah sekumpulan DNA yang berulang-ulang yang terdiri daripada dua hingga tiga belas unit pengulangan nukleotida yang dianjurkan secara bersamaan.
Saiz
VNTRs lebih besar daripada STR. STR adalah lebih kecil daripada VNTRs.
Bilangan Nukleotida dalam Urutan Mengulang
Unit pengulang VNTR terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida. Unit pengulangan STR terdiri daripada 2 hingga 13 nukleotida.

Ringkasan - VNTR vs STR

VNTR dan STR adalah dua penanda genetik yang kuat yang digunakan dalam biologi molekul, terutamanya dalam bidang genetik forensik. VNTR adalah sejenis minisatellite dan STR adalah mikrosatelit. VNTR dan STR adalah DNA tanpa pengekodan, sangat berulang. Mereka mengulangi tandem. Struktur umum VNTR dan STR adalah sama. Walau bagaimanapun, bilangan nukleotida dalam urutan berulang dan panjangnya berbeza. VNTR telah mengulangi urutan yang terdiri daripada 10 hingga 100 nukleotida. STR telah mengulangi urutan yang terdiri daripada 2 hingga 13 nukleotida. Ini adalah perbezaan antara VNTR dan STR.

Muat turun Versi PDF VNTR vs STR

Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti nota kutipan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan antara VNTR dan STR.

Rujukan:

1. "Sains Genetik Forensik." CRG - Majlis untuk Genetik Bertanggungjawab. N.p., n.d. Web. Terdapat di sini. 10 Julai 2017.
2. "analisis STR." Wikipedia. Yayasan Wikimedia, 22 Mac 2017. Web. Terdapat di sini. 10 Julai 2017.

Image Courtesy:

1. "D1S80Demo" Oleh PaleWhaleGail di Wikipedia Bahasa Inggeris (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons