Pengklonan DNA adalah proses penting yang membolehkan penyebaran serpihan DNA penting organisma. Ia memerlukan gabungan DNA khusus dengan DNA vektor untuk menghasilkan DNA rekombinan yang berubah menjadi organisme tuan rumah. Sebuah vektor adalah molekul DNA yang bertindak sebagai kenderaan untuk membawa bahan genetik asing ke dalam sel atau organisma lain. Ia sepatutnya mampu mereplikasi di dalam organisma tuan rumah dan menghasilkan beberapa salinan DNA rekombinan. Terdapat pelbagai jenis vektor yang digunakan dalam kloning DNA. Kromosom buatan ragi (YAC) dan vektor phage M13 adalah dua jenis di antara mereka. Perbezaan utama antara vektor php YAC dan M13 ialah YAC adalah kromosom buatan yang mereplikasi sel-sel yis sementara M13 phage vektor adalah DNA tunggal bulat terkandas bacteriophage M13 yang mereplikasi dalam E coli sel.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah YAC itu
3. Apakah M13 Phage Vector
4. Side by Side Comparison - YAC vs M13 Phage Vector
5. Ringkasan
YAC adalah kromosom yang dibina secara buatan yang mempunyai keupayaan untuk membawa segmen besar DNA asing dan mereplikasi dalam sel yis. Ia mempunyai centromere, telomere dan urutan replikasi secara autonomi yang penting untuk replikasi dan kestabilan. YAC juga harus menanggung penanda selektif atau penanda dan laman sekatan untuk menjadikannya vektor kloning berkesan. Urutan besar dari 1000 kb hingga 2000 kb boleh dimasukkan ke dalam YAC dan dipindahkan ke ragi.
Rajah 01: YAC Vector
Bacteriophage M13 adalah virus yang menjangkiti dan mereplikasi E coli. Genomong bakteria M13 bersaiz kecil, kira-kira 6.7 kb. Ia adalah satu DNA terkandas, bulat dan positif. Virus ini secara khusus menjangkiti E coli bakteria melalui F pilus. Sebaik sahaja ia memasuki ssDNA ke dalam bakteria, ia mensintesis strand pelengkap dan menjadi dsDNA atau bentuk replikatif (RF) M13. RF boleh bertindak seperti plasmid dalam organisma tuan rumah. DsDNA mereplikasi dalam E coli dan menghasilkan ssDNA yang mengandungi phage baru. Fasa baru ini secara berterusan dilepaskan dari E coli tanpa membunuh sel hos. Walau bagaimanapun, jangkitan itu melambatkan pertumbuhan E Coli. dsDNA boleh diekstrak dari sel bakteria dan digunakan sebagai vektor dalam pengklonan DNA. Mereka dikenali sebagai vektor vektor M13. Mereka boleh dengan mudah dimanipulasi dan digunakan sama dengan vektor plasmid.
Keupayaan jangkitan fasa M13 ini berfungsi sebagai kelayakan yang baik untuk digunakan sebagai vektor dalam kloning gen. Apabila membangunkan M13 menjadi vektor, beberapa unsur harus dimasukkan ke dalam genomnya. Mereka adalah, gen untuk protein penangkap lac (lac I), rantau operator-proximal lac Z gen, penganjur lac dan tapak pengklonan berganda (polylinker). Apabila dsDNA daripada M13 digunakan sebagai vektor, ia boleh dianggap sebagai vektor plasmid. Walau bagaimanapun, penggunaan ssDNA M13 mempunyai kelebihan dalam penjujukan DNA dan mutagenesis yang diarahkan oleh tapak.
Sejak vektor phage M13 mempunyai banyak tapak pengklonan dalam lacZ rantau, vektor rekombinan boleh dikenalpasti dengan mudah oleh pemeriksaan koloni biru / putih pada plat agar yang mengandungi IPTG dan X-Gal. Plak biru yang dihasilkan di atas pinggan tidak mengandungi phages semula. Oleh itu, phages dengan sisipan boleh dipilih untuk tujuan kloning.
Rajah 02: Bacteriophage M13
YAC vs M13 Phage Vector | |
YAC adalah kromosom kejuruteraan genetik yang mempunyai keupayaan untuk membawa segmen besar DNA asing dan meniru dalam sel-sel yis. | Vektor vektor M13 adalah vektor vektor yang dibangunkan oleh bakteria M13 yang digunakan untuk memasukkan DNA asing ke dalam E coli. |
Tujuan | |
YAC direka bentuk untuk mengkloning serpihan besar DNA genomik ke dalam ragi. | M13 vektor vektor digunakan untuk memasukkan DNA asing ke dalam E coli. |
Masukkan Panjang | |
YACs boleh mengandungi sisipan genomik berukuran megabase (1000 kb - 2000 kb). | Saiz sisipan adalah kira-kira 1,500 bps. |
Pembinaan | |
YAC DNA sukar untuk membersihkan utuh dan memerlukan tumpuan yang tinggi untuk menghasilkan sistem vektor YAC. | Ia berlaku melalui rantai elektron fotosintesis kitaran. |
Kestabilan | |
YAC tidak stabil. | M13 phages boleh dengan mudah diekstrak. |
Saiz | |
Enzim adalah molekul yang lebih besar. | M13 phages stabil daripada YAC. |
YAC adalah sistem vektor buatan yang dibina menggunakan rantau kromosom rantau tertentu untuk memasukkan segmen besar bahan genetik ke sel yis. M13 phage vektor adalah sistem vektor yang diperolehi daripada bakteria M 13 yang menggunakannya E coli sebagai organisma tuan rumah. Ini adalah perbezaan utama antara YAC dan M13 Phage Vector. Kedua-duanya sama-sama berguna dalam teknologi DNA rekombinan dan kloning gen.
Rujukan:
1. "Vektor." Nota genetik - Vektor. N.p., n.d. Web. 16 Mei 2017. https://genetics-notes.wikispaces.com/Vector
2. "Kromosom buatan ragi." Wikipedia. Yayasan Wikimedia, 21 Apr. 2017. Web. 16 Mei 2017. .
Image Courtesy:
1. "M13B" Oleh J3D3 - Kerja sendiri (CC BY-SA 3.0) melalui Wikimedia Commons