FAT32 dan NTFS adalah sistem fail iaitu, satu set pembentukan logik yang boleh digunakan oleh sistem operasi untuk mengesan menguruskan fail pada jumlah cakera.
FAT (Jadual Alokasi Fail) telah dicipta oleh Bill Gates dan Marc McDonald pada tahun 1977. Ia telah mengalami banyak perubahan sejak itu. Nombor "32" dalam FAT32 menandakan bilangan bit yang diperlukan untuk mengesan fail. FAT16 sangat popular sehingga kedatangan cakera keras 4GB. NTFS dilahirkan dari sistem fail HPFS dengan kerjasama Microsoft dan IBM. NTFS muncul pada mulanya untuk platform Windows NT. Sejak itu ia telah berkembang dan muncul dalam versi Windows baru seperti Vista, XP. Microsoft terus berpegang kepada paten NTFS.
FAT32 adalah sistem tanpa fluff dan mudah yang didokumenkan dan terutamanya menjejaki lokasi fail. Kesederhanaan FAT32 menjadikannya sistem fail pilihan untuk medium penyimpanan mudah alih seperti dalam kad memori, pemain mp3 dan pemain flash. Sistem fail NTFS lebih kompleks dan menawarkan pelbagai peningkatan yang meningkatkan keselamatan serta prestasi. Sistem fail NTFS membolehkan pemampatan fail automatik sebelum dituliskan membebaskan ruang cakera keras dan juga mempunyai kuota cakera yang membolehkan pentadbir sistem memperuntukkan ruang cakera kepada pengguna.
FAT32 adalah turunan dari Jadual Alokasi Fail (FAT) yang menyokong pemacu dengan penyimpanan lebih daripada 2GB. Fail yang paling besar ialah 4GB minus 2 bait. Berbanding dengan versi terdahulu, FAT32 menggunakan kluster kecil dan dengan itu menggunakan ruang lebih berkesan. Ia boleh memindahkan folder akar dan menggunakan salinan sandaran FAT bukan salinan default. NTFS jauh lebih fleksibel daripada FAT32. NTFS melakukan penyulitan peringkat fail, sokongan fail jarang, kuota penggunaan cakera, pengesanan pautan diedarkan, pemampatan fail, pengurusan storan hierarki dan lain-lain.
FAT32 boleh ditukar kepada NTFS tetapi tidak begitu mudah untuk menukar NTFS kembali ke FAT. NTFS mempunyai keselamatan yang hebat, fail oleh pemampatan fail, kuota dan enkripsi fail. Sekiranya terdapat lebih daripada satu sistem operasi pada satu komputer, lebih baik memformatkan beberapa volum sebagai FAT32.
Menggunakan pelbagai sistem operasi di komputer yang sama akan menjadikan FAT32 pilihan yang lebih baik jika anda mahu kedua-dua OS membaca cakera. Sekiranya hanya terdapat Windows OS, NTFS sangat baik. Oleh itu, dalam NTFS sistem komputer Windows adalah pilihan yang lebih baik.