Perbezaan Antara Penggantian Senapang Juruterbang Hierarki dan Seluruh

The perbezaan utama antara penjujukan senar genom hierarki dan seluruhnya dalam penjujukan senapang hierarki, genom dipecah menjadi serpihan yang lebih besar sebelum penjujukan sementara, dalam penjujukan senar genom keseluruhan, seluruh genom dipecahkan kepada serpihan kecil untuk penjujukan.

Urutan adalah teknik penting dalam proses molekul, terutamanya dalam pengenalan spesifik tepat. Malah, ia adalah teknik mengenal pasti urutan yang tepat nukleotida dalam gen atau genom. Terdapat banyak teknik untuk penjujukan. Beberapa di antaranya ialah Kaedah Maxam Gilbert, Kaedah Sanger dan kaedah Sanger automatik.

KANDUNGAN

1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apakah Sequence Shotgun Hierarki
3. Apa yang dimaksudkan dengan Sequence Shotgun Genome?
4. Kesamaan Antara Urutan Jenama Hierarki dan Seluruh Genom
5. Side by Side Comparison - Hierarchical vs Whole Genome Sequencing Sequencing dalam Borang Tabular
6. Ringkasan

Apakah urutan Seutas Senapang Hierarki?

Penjujukan Senjata Hierarki adalah satu kaedah penjujukan. Ia juga dipanggil 'urutan ke bawah'. Selanjutnya, kaedah ini terdiri daripada dua langkah: langkah pertama adalah penguatan genom, dan langkah kedua adalah pemecahan genom. Dalam kaedah ini, genom dipecahkan kepada serpihan besar terlebih dahulu. Ia diikuti oleh pengklonan serpihan besar ini ke dalam pelbagai tuan rumah menggunakan vektor atau kromosom tiruan. Kemudian, vektor rekombinan ini disusun ke dalam perpustakaan. Semasa penjujukan senapang patah, klon vektor rekombinan menjalani penjujukan secara individu. Serpihan dalam klon menjalani penghadaman sekatan untuk mengurangkan lagi saiz genom, dengan itu menjalani penjujukan.

Rajah 01: Sequencing Shotgun Hierarchical

Semasa urutan urutan pukulan hierarki, potongan-potongan besar serpihan perlu disusun mengikut urutan, sebelum penjejakan senapang patah. Ia berlaku dengan bantuan penanda molekul yang diperbadankan semasa proses kloning.

Penjejakan senapang patah hierarki mencipta peta gen resolusi rendah. Tetapi ia membuat peta turutan yang diperintahkan. Oleh itu, ia mengambil masa yang lebih lama daripada penjujukan langsung. Kelewatan keseluruhan proses disebabkan penciptaan perpustakaan vektor rekombinan. Adakah ia juga teknik intensif buruh. Walau bagaimanapun, pada masa ini, teknik ini automatik untuk memudahkan kerja.

Apakah Seluruh Kejutan Senapang Genom Genome?

Susunan penjenayah genom keseluruhan ialah proses penjujukan langkah tunggal. Dalam proses ini, seluruh ricih genom berlaku terlebih dahulu. Berikutan itu, setiap serpihan kecil ini menjalani penjujukan secara rawak. Selepas selesai urutan, analisis urutan berlaku. Semasa analisis urutan, urutan bertindih dihapuskan, dan analisis bukanlah proses yang diperintahkan. Oleh itu, perhimpunan urutan adalah proses yang kurang cekap berbanding dengan penjujukan senapang patah hierarki. Walau bagaimanapun, proses penjujukan senapang genom keseluruhan lebih pantas, dan analisis keseluruhan genom boleh berlaku pada satu kes.

Apakah Kesamaan Antara Urutan Senapang Hierarki dan Seluruh Genom??

• Penjujukan senar genom hirarkis dan keseluruhan adalah dua pendekatan penjujukan.
• Kedua-duanya menjalani penjujukan Sanger atau kaedah penjujukan Sanger automatik.
• Mereka terlibat dalam menyusun serpihan DNA dan RNA.
• Selain itu, kedua-dua kaedah ini penting dalam diagnostik molekul dan tujuan penyelidikan.
• Pada masa ini, kedua-dua teknik adalah automatik atau berasaskan komputer.
• Kedua-dua teknik ini bergantung kepada pemecahan genom.

Apakah Perbezaan Antara Urutan Senapang Hierarki dan Seluruh Genom??

Penjejakan senapang patah hierarki menjana serpihan bersaiz besar berbanding dengan penjujukan senapang genom keseluruhan, yang berfungsi dengan serpihan kecil urutan. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara penjujukan senar genom hierarki dan keseluruhan. Selain itu, penjujukan senapang patah hierarki terdiri daripada dua langkah utama, manakala urutan genom keseluruhan genom bergantung pada satu langkah utama.

Selain itu, satu lagi perbezaan antara penjujukan senar genom hierarki dan seluruhnya adalah bahawa resolusi lebih tinggi dalam penjujukan senapang genom seluruhnya berbanding dengan penjujukan senapang patah hierarki.

Infographic di bawah meringkaskan perbezaan antara penjujukan senar genom hierarki dan keseluruhan.

Ringkasan - Sequencing Jenama Hierarki vs Seluruh Genom

Penjujukan senar hierarki dan keseluruhan-genom adalah dua teknik untuk menyusun genom besar. Urutan urutan shot hierarkis adalah proses penjajaran dua langkah di mana genom dipecah menjadi serpihan yang lebih besar. Sebaliknya, urutan genom peluru keseluruhan genom adalah penjujukan langkah tunggal di mana genom dipecahkan kepada serpihan kecil dan secara langsung disusun. Oleh itu, ini adalah perbezaan utama antara penjujukan senar genom hierarki dan keseluruhan. Selain itu, aspek teknikal mungkin berbeza di antara kedua teknik ini.

Rujukan:

1. Waterston, Robert H, et al. "Pada Penjejakan Genom Manusia." Prosiding Akademi Sains Negara Amerika Syarikat, Akademi Sains Kebangsaan, 19 Mac 2002, Boleh didapati di sini.
2. Pal, Shital. "Genome Sequencing." LinkedIn SlideShare, 4 Nov. 2014, Available here.

Image Courtesy:

1. "Susunan urutan senapang genom keseluruhan berbanding penjujukan senapang patah Hierarchical" oleh Commins, J., Toft, C., Tambang, M. A. - "Kaedah Biologi Komputasi dan Aplikasi mereka kepada Genomik Perbandingan Endokselular Bakteria Symbiotik Serangga." Biol. Prosedur Dalam Talian (2009). Diakses melalui SpringerImages (CC BY-SA 2.5) melalui Wikimedia Commons